Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL01

DSE, Dermatan-sulfate epimerase, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSEQ9UL01 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
DSEQ9UL01 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
DSEQ9UL01 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
DSEQ9UL01 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
DSEQ9UL01 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
DSEQ9UL01 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
DSEQ9UL01 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
DSEQ9UL01 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
DSEQ9UL01 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
DSEQ9UL01 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
DSEQ9UL01 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
DSEQ9UL01 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
DSEQ9UL01 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
DSEQ9UL01 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
DSEQ9UL01 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
DSEQ9UL01 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
DSEQ9UL01 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
DSEQ9UL01 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
DSEQ9UL01 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
DSEQ9UL01 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
DSEQ9UL01 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
DSEQ9UL01 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
DSEQ9UL01 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
DSEQ9UL01 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
DSEQ9UL01 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
DSEQ9UL01 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
DSEQ9UL01 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
DSEQ9UL01 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
DSEQ9UL01 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
DSEQ9UL01 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
DSEQ9UL01 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
DSEQ9UL01 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
DSEQ9UL01 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
DSEQ9UL01 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
DSEQ9UL01 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
DSEQ9UL01 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
DSEQ9UL01 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
DSEQ9UL01 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
DSEQ9UL01 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
DSEQ9UL01 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
DSEQ9UL01 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
DSEQ9UL01 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
DSEQ9UL01 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
DSEQ9UL01 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
DSEQ9UL01 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
DSEQ9UL01 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
DSEQ9UL01 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
DSEQ9UL01 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
DSEQ9UL01 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
DSEQ9UL01 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
DSEQ9UL01 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
DSEQ9UL01 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
DSEQ9UL01 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
DSEQ9UL01 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
DSEQ9UL01 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
DSEQ9UL01 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
DSEQ9UL01 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
DSEQ9UL01 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
DSEQ9UL01 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
DSEQ9UL01 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
DSEQ9UL01 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
DSEQ9UL01 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
DSEQ9UL01 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
DSEQ9UL01 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
DSEQ9UL01 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
DSEQ9UL01 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
DSEQ9UL01 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
DSEQ9UL01 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
DSEQ9UL01 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
DSEQ9UL01 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
DSEQ9UL01 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
DSEQ9UL01 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
DSEQ9UL01 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
DSEQ9UL01 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
DSEQ9UL01 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
DSEQ9UL01 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
DSEQ9UL01 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
DSEQ9UL01 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
DSEQ9UL01 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
DSEQ9UL01 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
DSEQ9UL01 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
DSEQ9UL01 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
DSEQ9UL01 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
DSEQ9UL01 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
DSEQ9UL01 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
DSEQ9UL01 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
DSEQ9UL01 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
DSEQ9UL01 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
DSEQ9UL01 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
DSEQ9UL01 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
DSEQ9UL01 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
DSEQ9UL01 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
DSEQ9UL01 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
DSEQ9UL01 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
DSEQ9UL01 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
DSEQ9UL01 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
DSEQ9UL01 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
DSEQ9UL01 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
DSEQ9UL01 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
DSEQ9UL01 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms