Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKJ3

GPATCH8, G patch domain-containing protein 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPATCH8Q9UKJ3 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GPATCH8Q9UKJ3 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GPATCH8Q9UKJ3 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GPATCH8Q9UKJ3 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GPATCH8Q9UKJ3 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GPATCH8Q9UKJ3 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GPATCH8Q9UKJ3 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GPATCH8Q9UKJ3 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GPATCH8Q9UKJ3 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GPATCH8Q9UKJ3 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GPATCH8Q9UKJ3 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
GPATCH8Q9UKJ3 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GPATCH8Q9UKJ3 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GPATCH8Q9UKJ3 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GPATCH8Q9UKJ3 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
GPATCH8Q9UKJ3 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GPATCH8Q9UKJ3 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GPATCH8Q9UKJ3 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GPATCH8Q9UKJ3 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GPATCH8Q9UKJ3 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GPATCH8Q9UKJ3 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GPATCH8Q9UKJ3 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GPATCH8Q9UKJ3 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GPATCH8Q9UKJ3 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GPATCH8Q9UKJ3 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GPATCH8Q9UKJ3 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GPATCH8Q9UKJ3 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GPATCH8Q9UKJ3 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GPATCH8Q9UKJ3 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GPATCH8Q9UKJ3 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GPATCH8Q9UKJ3 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GPATCH8Q9UKJ3 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GPATCH8Q9UKJ3 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GPATCH8Q9UKJ3 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GPATCH8Q9UKJ3 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
GPATCH8Q9UKJ3 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GPATCH8Q9UKJ3 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
GPATCH8Q9UKJ3 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GPATCH8Q9UKJ3 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GPATCH8Q9UKJ3 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GPATCH8Q9UKJ3 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GPATCH8Q9UKJ3 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
GPATCH8Q9UKJ3 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GPATCH8Q9UKJ3 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
GPATCH8Q9UKJ3 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
GPATCH8Q9UKJ3 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
GPATCH8Q9UKJ3 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.11
GPATCH8Q9UKJ3 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
GPATCH8Q9UKJ3 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
GPATCH8Q9UKJ3 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GPATCH8Q9UKJ3 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GPATCH8Q9UKJ3 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
GPATCH8Q9UKJ3 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GPATCH8Q9UKJ3 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GPATCH8Q9UKJ3 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GPATCH8Q9UKJ3 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GPATCH8Q9UKJ3 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GPATCH8Q9UKJ3 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GPATCH8Q9UKJ3 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GPATCH8Q9UKJ3 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GPATCH8Q9UKJ3 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GPATCH8Q9UKJ3 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GPATCH8Q9UKJ3 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GPATCH8Q9UKJ3 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GPATCH8Q9UKJ3 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GPATCH8Q9UKJ3 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GPATCH8Q9UKJ3 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GPATCH8Q9UKJ3 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GPATCH8Q9UKJ3 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GPATCH8Q9UKJ3 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GPATCH8Q9UKJ3 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GPATCH8Q9UKJ3 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GPATCH8Q9UKJ3 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GPATCH8Q9UKJ3 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
GPATCH8Q9UKJ3 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
GPATCH8Q9UKJ3 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GPATCH8Q9UKJ3 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GPATCH8Q9UKJ3 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GPATCH8Q9UKJ3 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GPATCH8Q9UKJ3 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GPATCH8Q9UKJ3 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GPATCH8Q9UKJ3 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GPATCH8Q9UKJ3 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GPATCH8Q9UKJ3 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GPATCH8Q9UKJ3 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GPATCH8Q9UKJ3 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GPATCH8Q9UKJ3 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GPATCH8Q9UKJ3 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GPATCH8Q9UKJ3 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GPATCH8Q9UKJ3 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GPATCH8Q9UKJ3 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GPATCH8Q9UKJ3 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GPATCH8Q9UKJ3 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GPATCH8Q9UKJ3 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GPATCH8Q9UKJ3 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GPATCH8Q9UKJ3 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
GPATCH8Q9UKJ3 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GPATCH8Q9UKJ3 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GPATCH8Q9UKJ3 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GPATCH8Q9UKJ3 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms