Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI2

CDC42EP3, Cdc42 effector protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP3Q9UKI2 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC42EP3Q9UKI2 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms