Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJY5

GGA1, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA1, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA1Q9UJY5 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GGA1Q9UJY5 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GGA1Q9UJY5 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GGA1Q9UJY5 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GGA1Q9UJY5 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GGA1Q9UJY5 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GGA1Q9UJY5 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GGA1Q9UJY5 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GGA1Q9UJY5 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GGA1Q9UJY5 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GGA1Q9UJY5 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GGA1Q9UJY5 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GGA1Q9UJY5 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GGA1Q9UJY5 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GGA1Q9UJY5 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GGA1Q9UJY5 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GGA1Q9UJY5 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GGA1Q9UJY5 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GGA1Q9UJY5 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GGA1Q9UJY5 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GGA1Q9UJY5 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GGA1Q9UJY5 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GGA1Q9UJY5 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GGA1Q9UJY5 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GGA1Q9UJY5 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GGA1Q9UJY5 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GGA1Q9UJY5 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GGA1Q9UJY5 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GGA1Q9UJY5 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GGA1Q9UJY5 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GGA1Q9UJY5 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GGA1Q9UJY5 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GGA1Q9UJY5 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GGA1Q9UJY5 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GGA1Q9UJY5 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GGA1Q9UJY5 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GGA1Q9UJY5 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GGA1Q9UJY5 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GGA1Q9UJY5 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GGA1Q9UJY5 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GGA1Q9UJY5 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GGA1Q9UJY5 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GGA1Q9UJY5 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GGA1Q9UJY5 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GGA1Q9UJY5 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GGA1Q9UJY5 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GGA1Q9UJY5 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GGA1Q9UJY5 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GGA1Q9UJY5 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GGA1Q9UJY5 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GGA1Q9UJY5 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GGA1Q9UJY5 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GGA1Q9UJY5 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GGA1Q9UJY5 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GGA1Q9UJY5 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GGA1Q9UJY5 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GGA1Q9UJY5 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GGA1Q9UJY5 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GGA1Q9UJY5 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GGA1Q9UJY5 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GGA1Q9UJY5 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GGA1Q9UJY5 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GGA1Q9UJY5 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GGA1Q9UJY5 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GGA1Q9UJY5 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GGA1Q9UJY5 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GGA1Q9UJY5 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GGA1Q9UJY5 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GGA1Q9UJY5 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GGA1Q9UJY5 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GGA1Q9UJY5 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GGA1Q9UJY5 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GGA1Q9UJY5 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GGA1Q9UJY5 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GGA1Q9UJY5 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GGA1Q9UJY5 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GGA1Q9UJY5 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GGA1Q9UJY5 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GGA1Q9UJY5 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GGA1Q9UJY5 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GGA1Q9UJY5 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GGA1Q9UJY5 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GGA1Q9UJY5 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GGA1Q9UJY5 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GGA1Q9UJY5 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GGA1Q9UJY5 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GGA1Q9UJY5 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GGA1Q9UJY5 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GGA1Q9UJY5 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GGA1Q9UJY5 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GGA1Q9UJY5 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GGA1Q9UJY5 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GGA1Q9UJY5 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GGA1Q9UJY5 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GGA1Q9UJY5 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GGA1Q9UJY5 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GGA1Q9UJY5 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GGA1Q9UJY5 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GGA1Q9UJY5 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GGA1Q9UJY5 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms