Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RABGEF1Q9UJ41 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RABGEF1Q9UJ41 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
RABGEF1Q9UJ41 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RABGEF1Q9UJ41 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RABGEF1Q9UJ41 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RABGEF1Q9UJ41 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
RABGEF1Q9UJ41 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
RABGEF1Q9UJ41 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RABGEF1Q9UJ41 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RABGEF1Q9UJ41 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RABGEF1Q9UJ41 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RABGEF1Q9UJ41 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RABGEF1Q9UJ41 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RABGEF1Q9UJ41 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RABGEF1Q9UJ41 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RABGEF1Q9UJ41 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RABGEF1Q9UJ41 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RABGEF1Q9UJ41 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RABGEF1Q9UJ41 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RABGEF1Q9UJ41 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RABGEF1Q9UJ41 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RABGEF1Q9UJ41 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RABGEF1Q9UJ41 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RABGEF1Q9UJ41 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RABGEF1Q9UJ41 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RABGEF1Q9UJ41 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RABGEF1Q9UJ41 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RABGEF1Q9UJ41 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
RABGEF1Q9UJ41 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RABGEF1Q9UJ41 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RABGEF1Q9UJ41 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
RABGEF1Q9UJ41 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RABGEF1Q9UJ41 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
RABGEF1Q9UJ41 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RABGEF1Q9UJ41 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RABGEF1Q9UJ41 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RABGEF1Q9UJ41 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RABGEF1Q9UJ41 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RABGEF1Q9UJ41 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RABGEF1Q9UJ41 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RABGEF1Q9UJ41 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RABGEF1Q9UJ41 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RABGEF1Q9UJ41 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RABGEF1Q9UJ41 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RABGEF1Q9UJ41 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RABGEF1Q9UJ41 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RABGEF1Q9UJ41 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RABGEF1Q9UJ41 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RABGEF1Q9UJ41 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RABGEF1Q9UJ41 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RABGEF1Q9UJ41 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
RABGEF1Q9UJ41 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RABGEF1Q9UJ41 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RABGEF1Q9UJ41 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RABGEF1Q9UJ41 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RABGEF1Q9UJ41 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
RABGEF1Q9UJ41 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RABGEF1Q9UJ41 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RABGEF1Q9UJ41 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RABGEF1Q9UJ41 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RABGEF1Q9UJ41 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RABGEF1Q9UJ41 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RABGEF1Q9UJ41 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RABGEF1Q9UJ41 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
RABGEF1Q9UJ41 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RABGEF1Q9UJ41 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RABGEF1Q9UJ41 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RABGEF1Q9UJ41 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RABGEF1Q9UJ41 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RABGEF1Q9UJ41 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RABGEF1Q9UJ41 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RABGEF1Q9UJ41 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
RABGEF1Q9UJ41 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RABGEF1Q9UJ41 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RABGEF1Q9UJ41 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RABGEF1Q9UJ41 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RABGEF1Q9UJ41 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RABGEF1Q9UJ41 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RABGEF1Q9UJ41 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RABGEF1Q9UJ41 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RABGEF1Q9UJ41 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RABGEF1Q9UJ41 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RABGEF1Q9UJ41 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RABGEF1Q9UJ41 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
RABGEF1Q9UJ41 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RABGEF1Q9UJ41 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
RABGEF1Q9UJ41 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RABGEF1Q9UJ41 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
RABGEF1Q9UJ41 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
RABGEF1Q9UJ41 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.66
RABGEF1Q9UJ41 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
RABGEF1Q9UJ41 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RABGEF1Q9UJ41 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RABGEF1Q9UJ41 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
RABGEF1Q9UJ41 DCD-201ENST00000293371 645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RABGEF1Q9UJ41 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RABGEF1Q9UJ41 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
RABGEF1Q9UJ41 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RABGEF1Q9UJ41 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms