Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIS9

MBD1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD1Q9UIS9 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MBD1Q9UIS9 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MBD1Q9UIS9 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MBD1Q9UIS9 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MBD1Q9UIS9 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MBD1Q9UIS9 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MBD1Q9UIS9 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MBD1Q9UIS9 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MBD1Q9UIS9 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MBD1Q9UIS9 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
MBD1Q9UIS9 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MBD1Q9UIS9 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MBD1Q9UIS9 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MBD1Q9UIS9 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MBD1Q9UIS9 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MBD1Q9UIS9 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MBD1Q9UIS9 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MBD1Q9UIS9 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MBD1Q9UIS9 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MBD1Q9UIS9 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MBD1Q9UIS9 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MBD1Q9UIS9 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MBD1Q9UIS9 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MBD1Q9UIS9 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MBD1Q9UIS9 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MBD1Q9UIS9 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MBD1Q9UIS9 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MBD1Q9UIS9 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MBD1Q9UIS9 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MBD1Q9UIS9 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MBD1Q9UIS9 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MBD1Q9UIS9 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
MBD1Q9UIS9 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MBD1Q9UIS9 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
MBD1Q9UIS9 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
MBD1Q9UIS9 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
MBD1Q9UIS9 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
MBD1Q9UIS9 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
MBD1Q9UIS9 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
MBD1Q9UIS9 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
MBD1Q9UIS9 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
MBD1Q9UIS9 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
MBD1Q9UIS9 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
MBD1Q9UIS9 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MBD1Q9UIS9 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
MBD1Q9UIS9 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MBD1Q9UIS9 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
MBD1Q9UIS9 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
MBD1Q9UIS9 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
MBD1Q9UIS9 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
MBD1Q9UIS9 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MBD1Q9UIS9 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MBD1Q9UIS9 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MBD1Q9UIS9 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MBD1Q9UIS9 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
MBD1Q9UIS9 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MBD1Q9UIS9 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MBD1Q9UIS9 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
MBD1Q9UIS9 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MBD1Q9UIS9 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MBD1Q9UIS9 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MBD1Q9UIS9 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MBD1Q9UIS9 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MBD1Q9UIS9 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MBD1Q9UIS9 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MBD1Q9UIS9 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MBD1Q9UIS9 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MBD1Q9UIS9 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MBD1Q9UIS9 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MBD1Q9UIS9 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MBD1Q9UIS9 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MBD1Q9UIS9 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
MBD1Q9UIS9 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MBD1Q9UIS9 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MBD1Q9UIS9 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MBD1Q9UIS9 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MBD1Q9UIS9 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MBD1Q9UIS9 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MBD1Q9UIS9 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MBD1Q9UIS9 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MBD1Q9UIS9 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MBD1Q9UIS9 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MBD1Q9UIS9 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MBD1Q9UIS9 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
MBD1Q9UIS9 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
MBD1Q9UIS9 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
MBD1Q9UIS9 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MBD1Q9UIS9 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MBD1Q9UIS9 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MBD1Q9UIS9 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
MBD1Q9UIS9 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
MBD1Q9UIS9 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
MBD1Q9UIS9 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
MBD1Q9UIS9 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MBD1Q9UIS9 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MBD1Q9UIS9 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MBD1Q9UIS9 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MBD1Q9UIS9 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MBD1Q9UIS9 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MBD1Q9UIS9 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms