Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEE9

CFDP1, Craniofacial development protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP1Q9UEE9 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CFDP1Q9UEE9 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CFDP1Q9UEE9 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CFDP1Q9UEE9 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CFDP1Q9UEE9 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CFDP1Q9UEE9 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CFDP1Q9UEE9 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CFDP1Q9UEE9 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
CFDP1Q9UEE9 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
CFDP1Q9UEE9 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CFDP1Q9UEE9 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CFDP1Q9UEE9 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CFDP1Q9UEE9 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
CFDP1Q9UEE9 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CFDP1Q9UEE9 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CFDP1Q9UEE9 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CFDP1Q9UEE9 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CFDP1Q9UEE9 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CFDP1Q9UEE9 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CFDP1Q9UEE9 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CFDP1Q9UEE9 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CFDP1Q9UEE9 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CFDP1Q9UEE9 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CFDP1Q9UEE9 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CFDP1Q9UEE9 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CFDP1Q9UEE9 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CFDP1Q9UEE9 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CFDP1Q9UEE9 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CFDP1Q9UEE9 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CFDP1Q9UEE9 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CFDP1Q9UEE9 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CFDP1Q9UEE9 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CFDP1Q9UEE9 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CFDP1Q9UEE9 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CFDP1Q9UEE9 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CFDP1Q9UEE9 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CFDP1Q9UEE9 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CFDP1Q9UEE9 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CFDP1Q9UEE9 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CFDP1Q9UEE9 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
CFDP1Q9UEE9 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
CFDP1Q9UEE9 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.12
CFDP1Q9UEE9 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CFDP1Q9UEE9 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CFDP1Q9UEE9 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CFDP1Q9UEE9 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CFDP1Q9UEE9 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CFDP1Q9UEE9 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CFDP1Q9UEE9 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CFDP1Q9UEE9 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CFDP1Q9UEE9 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CFDP1Q9UEE9 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
CFDP1Q9UEE9 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CFDP1Q9UEE9 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CFDP1Q9UEE9 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CFDP1Q9UEE9 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CFDP1Q9UEE9 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CFDP1Q9UEE9 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CFDP1Q9UEE9 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CFDP1Q9UEE9 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CFDP1Q9UEE9 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CFDP1Q9UEE9 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CFDP1Q9UEE9 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CFDP1Q9UEE9 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CFDP1Q9UEE9 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CFDP1Q9UEE9 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CFDP1Q9UEE9 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CFDP1Q9UEE9 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CFDP1Q9UEE9 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CFDP1Q9UEE9 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CFDP1Q9UEE9 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CFDP1Q9UEE9 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
CFDP1Q9UEE9 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CFDP1Q9UEE9 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CFDP1Q9UEE9 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CFDP1Q9UEE9 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CFDP1Q9UEE9 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CFDP1Q9UEE9 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CFDP1Q9UEE9 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CFDP1Q9UEE9 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CFDP1Q9UEE9 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CFDP1Q9UEE9 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CFDP1Q9UEE9 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CFDP1Q9UEE9 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CFDP1Q9UEE9 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CFDP1Q9UEE9 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CFDP1Q9UEE9 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CFDP1Q9UEE9 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CFDP1Q9UEE9 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CFDP1Q9UEE9 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CFDP1Q9UEE9 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CFDP1Q9UEE9 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CFDP1Q9UEE9 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CFDP1Q9UEE9 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CFDP1Q9UEE9 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
CFDP1Q9UEE9 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CFDP1Q9UEE9 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CFDP1Q9UEE9 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CFDP1Q9UEE9 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CFDP1Q9UEE9 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms