Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDY4

DNAJB4, DnaJ homolog subfamily B member 4, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJB4Q9UDY4 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAJB4Q9UDY4 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAJB4Q9UDY4 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAJB4Q9UDY4 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAJB4Q9UDY4 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAJB4Q9UDY4 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAJB4Q9UDY4 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAJB4Q9UDY4 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAJB4Q9UDY4 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAJB4Q9UDY4 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAJB4Q9UDY4 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAJB4Q9UDY4 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAJB4Q9UDY4 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAJB4Q9UDY4 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAJB4Q9UDY4 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAJB4Q9UDY4 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAJB4Q9UDY4 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAJB4Q9UDY4 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAJB4Q9UDY4 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAJB4Q9UDY4 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAJB4Q9UDY4 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNAJB4Q9UDY4 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
DNAJB4Q9UDY4 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
DNAJB4Q9UDY4 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNAJB4Q9UDY4 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNAJB4Q9UDY4 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNAJB4Q9UDY4 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNAJB4Q9UDY4 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNAJB4Q9UDY4 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNAJB4Q9UDY4 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNAJB4Q9UDY4 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNAJB4Q9UDY4 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNAJB4Q9UDY4 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNAJB4Q9UDY4 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNAJB4Q9UDY4 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNAJB4Q9UDY4 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNAJB4Q9UDY4 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNAJB4Q9UDY4 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNAJB4Q9UDY4 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNAJB4Q9UDY4 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNAJB4Q9UDY4 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DNAJB4Q9UDY4 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
DNAJB4Q9UDY4 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
DNAJB4Q9UDY4 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DNAJB4Q9UDY4 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DNAJB4Q9UDY4 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DNAJB4Q9UDY4 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DNAJB4Q9UDY4 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DNAJB4Q9UDY4 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DNAJB4Q9UDY4 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DNAJB4Q9UDY4 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
DNAJB4Q9UDY4 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
DNAJB4Q9UDY4 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DNAJB4Q9UDY4 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
DNAJB4Q9UDY4 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DNAJB4Q9UDY4 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
DNAJB4Q9UDY4 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DNAJB4Q9UDY4 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DNAJB4Q9UDY4 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DNAJB4Q9UDY4 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DNAJB4Q9UDY4 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DNAJB4Q9UDY4 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DNAJB4Q9UDY4 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DNAJB4Q9UDY4 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DNAJB4Q9UDY4 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
DNAJB4Q9UDY4 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DNAJB4Q9UDY4 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DNAJB4Q9UDY4 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DNAJB4Q9UDY4 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DNAJB4Q9UDY4 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DNAJB4Q9UDY4 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DNAJB4Q9UDY4 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DNAJB4Q9UDY4 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DNAJB4Q9UDY4 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DNAJB4Q9UDY4 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DNAJB4Q9UDY4 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DNAJB4Q9UDY4 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DNAJB4Q9UDY4 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DNAJB4Q9UDY4 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DNAJB4Q9UDY4 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DNAJB4Q9UDY4 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DNAJB4Q9UDY4 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DNAJB4Q9UDY4 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DNAJB4Q9UDY4 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DNAJB4Q9UDY4 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DNAJB4Q9UDY4 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DNAJB4Q9UDY4 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DNAJB4Q9UDY4 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
DNAJB4Q9UDY4 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
DNAJB4Q9UDY4 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
DNAJB4Q9UDY4 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
DNAJB4Q9UDY4 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
DNAJB4Q9UDY4 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
DNAJB4Q9UDY4 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
DNAJB4Q9UDY4 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
DNAJB4Q9UDY4 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
DNAJB4Q9UDY4 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
DNAJB4Q9UDY4 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
DNAJB4Q9UDY4 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
DNAJB4Q9UDY4 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.7 ms