Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
DKK2Q9UBU2 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms