Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J3

KLHL9, Kelch-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL9Q9P2J3 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms