Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SH3BP4Q9P0V3 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SH3BP4Q9P0V3 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SH3BP4Q9P0V3 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SH3BP4Q9P0V3 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SH3BP4Q9P0V3 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SH3BP4Q9P0V3 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SH3BP4Q9P0V3 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SH3BP4Q9P0V3 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SH3BP4Q9P0V3 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SH3BP4Q9P0V3 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SH3BP4Q9P0V3 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SH3BP4Q9P0V3 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SH3BP4Q9P0V3 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SH3BP4Q9P0V3 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SH3BP4Q9P0V3 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SH3BP4Q9P0V3 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SH3BP4Q9P0V3 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SH3BP4Q9P0V3 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SH3BP4Q9P0V3 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SH3BP4Q9P0V3 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SH3BP4Q9P0V3 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SH3BP4Q9P0V3 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SH3BP4Q9P0V3 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SH3BP4Q9P0V3 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SH3BP4Q9P0V3 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SH3BP4Q9P0V3 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SH3BP4Q9P0V3 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SH3BP4Q9P0V3 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SH3BP4Q9P0V3 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SH3BP4Q9P0V3 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SH3BP4Q9P0V3 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SH3BP4Q9P0V3 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SH3BP4Q9P0V3 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SH3BP4Q9P0V3 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SH3BP4Q9P0V3 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SH3BP4Q9P0V3 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SH3BP4Q9P0V3 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SH3BP4Q9P0V3 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SH3BP4Q9P0V3 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SH3BP4Q9P0V3 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SH3BP4Q9P0V3 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SH3BP4Q9P0V3 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SH3BP4Q9P0V3 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SH3BP4Q9P0V3 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SH3BP4Q9P0V3 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SH3BP4Q9P0V3 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SH3BP4Q9P0V3 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SH3BP4Q9P0V3 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SH3BP4Q9P0V3 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SH3BP4Q9P0V3 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SH3BP4Q9P0V3 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SH3BP4Q9P0V3 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SH3BP4Q9P0V3 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SH3BP4Q9P0V3 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SH3BP4Q9P0V3 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SH3BP4Q9P0V3 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SH3BP4Q9P0V3 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SH3BP4Q9P0V3 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SH3BP4Q9P0V3 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SH3BP4Q9P0V3 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SH3BP4Q9P0V3 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SH3BP4Q9P0V3 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SH3BP4Q9P0V3 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SH3BP4Q9P0V3 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SH3BP4Q9P0V3 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SH3BP4Q9P0V3 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SH3BP4Q9P0V3 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SH3BP4Q9P0V3 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SH3BP4Q9P0V3 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SH3BP4Q9P0V3 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SH3BP4Q9P0V3 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SH3BP4Q9P0V3 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SH3BP4Q9P0V3 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SH3BP4Q9P0V3 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SH3BP4Q9P0V3 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SH3BP4Q9P0V3 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SH3BP4Q9P0V3 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SH3BP4Q9P0V3 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SH3BP4Q9P0V3 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SH3BP4Q9P0V3 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SH3BP4Q9P0V3 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SH3BP4Q9P0V3 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SH3BP4Q9P0V3 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SH3BP4Q9P0V3 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SH3BP4Q9P0V3 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SH3BP4Q9P0V3 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SH3BP4Q9P0V3 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SH3BP4Q9P0V3 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SH3BP4Q9P0V3 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SH3BP4Q9P0V3 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SH3BP4Q9P0V3 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SH3BP4Q9P0V3 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SH3BP4Q9P0V3 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SH3BP4Q9P0V3 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SH3BP4Q9P0V3 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SH3BP4Q9P0V3 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SH3BP4Q9P0V3 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SH3BP4Q9P0V3 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SH3BP4Q9P0V3 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
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