Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZZ3

CHMP5, Charged multivesicular body protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP5Q9NZZ3 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHMP5Q9NZZ3 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHMP5Q9NZZ3 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHMP5Q9NZZ3 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHMP5Q9NZZ3 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHMP5Q9NZZ3 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHMP5Q9NZZ3 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHMP5Q9NZZ3 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHMP5Q9NZZ3 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHMP5Q9NZZ3 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHMP5Q9NZZ3 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHMP5Q9NZZ3 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHMP5Q9NZZ3 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHMP5Q9NZZ3 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHMP5Q9NZZ3 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CHMP5Q9NZZ3 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CHMP5Q9NZZ3 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHMP5Q9NZZ3 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHMP5Q9NZZ3 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHMP5Q9NZZ3 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHMP5Q9NZZ3 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHMP5Q9NZZ3 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHMP5Q9NZZ3 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHMP5Q9NZZ3 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHMP5Q9NZZ3 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHMP5Q9NZZ3 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHMP5Q9NZZ3 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHMP5Q9NZZ3 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHMP5Q9NZZ3 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHMP5Q9NZZ3 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHMP5Q9NZZ3 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHMP5Q9NZZ3 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHMP5Q9NZZ3 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHMP5Q9NZZ3 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHMP5Q9NZZ3 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHMP5Q9NZZ3 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHMP5Q9NZZ3 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHMP5Q9NZZ3 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHMP5Q9NZZ3 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHMP5Q9NZZ3 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHMP5Q9NZZ3 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CHMP5Q9NZZ3 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHMP5Q9NZZ3 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHMP5Q9NZZ3 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHMP5Q9NZZ3 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHMP5Q9NZZ3 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CHMP5Q9NZZ3 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHMP5Q9NZZ3 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHMP5Q9NZZ3 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHMP5Q9NZZ3 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHMP5Q9NZZ3 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHMP5Q9NZZ3 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CHMP5Q9NZZ3 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHMP5Q9NZZ3 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHMP5Q9NZZ3 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CHMP5Q9NZZ3 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHMP5Q9NZZ3 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHMP5Q9NZZ3 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CHMP5Q9NZZ3 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CHMP5Q9NZZ3 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CHMP5Q9NZZ3 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CHMP5Q9NZZ3 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHMP5Q9NZZ3 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CHMP5Q9NZZ3 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CHMP5Q9NZZ3 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHMP5Q9NZZ3 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CHMP5Q9NZZ3 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CHMP5Q9NZZ3 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHMP5Q9NZZ3 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHMP5Q9NZZ3 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHMP5Q9NZZ3 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CHMP5Q9NZZ3 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CHMP5Q9NZZ3 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CHMP5Q9NZZ3 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CHMP5Q9NZZ3 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHMP5Q9NZZ3 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHMP5Q9NZZ3 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHMP5Q9NZZ3 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHMP5Q9NZZ3 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHMP5Q9NZZ3 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHMP5Q9NZZ3 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CHMP5Q9NZZ3 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHMP5Q9NZZ3 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHMP5Q9NZZ3 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHMP5Q9NZZ3 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHMP5Q9NZZ3 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHMP5Q9NZZ3 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHMP5Q9NZZ3 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHMP5Q9NZZ3 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHMP5Q9NZZ3 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CHMP5Q9NZZ3 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHMP5Q9NZZ3 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHMP5Q9NZZ3 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHMP5Q9NZZ3 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHMP5Q9NZZ3 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHMP5Q9NZZ3 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHMP5Q9NZZ3 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHMP5Q9NZZ3 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHMP5Q9NZZ3 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHMP5Q9NZZ3 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms