Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ53

PODXL2, Podocalyxin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PODXL2Q9NZ53 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PODXL2Q9NZ53 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PODXL2Q9NZ53 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PODXL2Q9NZ53 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PODXL2Q9NZ53 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PODXL2Q9NZ53 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PODXL2Q9NZ53 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PODXL2Q9NZ53 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PODXL2Q9NZ53 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PODXL2Q9NZ53 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PODXL2Q9NZ53 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PODXL2Q9NZ53 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PODXL2Q9NZ53 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PODXL2Q9NZ53 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PODXL2Q9NZ53 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PODXL2Q9NZ53 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PODXL2Q9NZ53 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PODXL2Q9NZ53 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PODXL2Q9NZ53 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PODXL2Q9NZ53 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PODXL2Q9NZ53 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PODXL2Q9NZ53 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PODXL2Q9NZ53 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PODXL2Q9NZ53 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PODXL2Q9NZ53 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PODXL2Q9NZ53 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PODXL2Q9NZ53 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PODXL2Q9NZ53 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PODXL2Q9NZ53 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PODXL2Q9NZ53 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
PODXL2Q9NZ53 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PODXL2Q9NZ53 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PODXL2Q9NZ53 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PODXL2Q9NZ53 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PODXL2Q9NZ53 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PODXL2Q9NZ53 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PODXL2Q9NZ53 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PODXL2Q9NZ53 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PODXL2Q9NZ53 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PODXL2Q9NZ53 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PODXL2Q9NZ53 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PODXL2Q9NZ53 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PODXL2Q9NZ53 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PODXL2Q9NZ53 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PODXL2Q9NZ53 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PODXL2Q9NZ53 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PODXL2Q9NZ53 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PODXL2Q9NZ53 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PODXL2Q9NZ53 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PODXL2Q9NZ53 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PODXL2Q9NZ53 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PODXL2Q9NZ53 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PODXL2Q9NZ53 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PODXL2Q9NZ53 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PODXL2Q9NZ53 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PODXL2Q9NZ53 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PODXL2Q9NZ53 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PODXL2Q9NZ53 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PODXL2Q9NZ53 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PODXL2Q9NZ53 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PODXL2Q9NZ53 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PODXL2Q9NZ53 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PODXL2Q9NZ53 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PODXL2Q9NZ53 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PODXL2Q9NZ53 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PODXL2Q9NZ53 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PODXL2Q9NZ53 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PODXL2Q9NZ53 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PODXL2Q9NZ53 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PODXL2Q9NZ53 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PODXL2Q9NZ53 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PODXL2Q9NZ53 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PODXL2Q9NZ53 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PODXL2Q9NZ53 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PODXL2Q9NZ53 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PODXL2Q9NZ53 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PODXL2Q9NZ53 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PODXL2Q9NZ53 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PODXL2Q9NZ53 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PODXL2Q9NZ53 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PODXL2Q9NZ53 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PODXL2Q9NZ53 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PODXL2Q9NZ53 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PODXL2Q9NZ53 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PODXL2Q9NZ53 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PODXL2Q9NZ53 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PODXL2Q9NZ53 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PODXL2Q9NZ53 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PODXL2Q9NZ53 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PODXL2Q9NZ53 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PODXL2Q9NZ53 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PODXL2Q9NZ53 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PODXL2Q9NZ53 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PODXL2Q9NZ53 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PODXL2Q9NZ53 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PODXL2Q9NZ53 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PODXL2Q9NZ53 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PODXL2Q9NZ53 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PODXL2Q9NZ53 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PODXL2Q9NZ53 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms