Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXS3

KLHL28, Kelch-like protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL28Q9NXS3 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL28Q9NXS3 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL28Q9NXS3 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL28Q9NXS3 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL28Q9NXS3 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL28Q9NXS3 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL28Q9NXS3 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL28Q9NXS3 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL28Q9NXS3 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL28Q9NXS3 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL28Q9NXS3 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL28Q9NXS3 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL28Q9NXS3 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL28Q9NXS3 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL28Q9NXS3 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL28Q9NXS3 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL28Q9NXS3 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL28Q9NXS3 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL28Q9NXS3 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL28Q9NXS3 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL28Q9NXS3 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL28Q9NXS3 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL28Q9NXS3 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL28Q9NXS3 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL28Q9NXS3 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL28Q9NXS3 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL28Q9NXS3 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL28Q9NXS3 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL28Q9NXS3 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL28Q9NXS3 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL28Q9NXS3 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL28Q9NXS3 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL28Q9NXS3 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL28Q9NXS3 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL28Q9NXS3 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL28Q9NXS3 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL28Q9NXS3 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL28Q9NXS3 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL28Q9NXS3 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL28Q9NXS3 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL28Q9NXS3 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL28Q9NXS3 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL28Q9NXS3 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL28Q9NXS3 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL28Q9NXS3 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL28Q9NXS3 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL28Q9NXS3 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
KLHL28Q9NXS3 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
KLHL28Q9NXS3 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
KLHL28Q9NXS3 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
KLHL28Q9NXS3 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
KLHL28Q9NXS3 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL28Q9NXS3 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL28Q9NXS3 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL28Q9NXS3 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL28Q9NXS3 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL28Q9NXS3 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL28Q9NXS3 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL28Q9NXS3 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL28Q9NXS3 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL28Q9NXS3 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL28Q9NXS3 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL28Q9NXS3 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL28Q9NXS3 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL28Q9NXS3 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL28Q9NXS3 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL28Q9NXS3 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL28Q9NXS3 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL28Q9NXS3 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL28Q9NXS3 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL28Q9NXS3 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL28Q9NXS3 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL28Q9NXS3 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL28Q9NXS3 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL28Q9NXS3 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL28Q9NXS3 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL28Q9NXS3 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL28Q9NXS3 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL28Q9NXS3 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL28Q9NXS3 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL28Q9NXS3 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL28Q9NXS3 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL28Q9NXS3 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL28Q9NXS3 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL28Q9NXS3 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL28Q9NXS3 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL28Q9NXS3 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL28Q9NXS3 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL28Q9NXS3 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL28Q9NXS3 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL28Q9NXS3 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL28Q9NXS3 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL28Q9NXS3 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL28Q9NXS3 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL28Q9NXS3 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL28Q9NXS3 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL28Q9NXS3 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL28Q9NXS3 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL28Q9NXS3 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL28Q9NXS3 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms