Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTJ3

SMC4, Structural maintenance of chromosomes protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC4Q9NTJ3 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMC4Q9NTJ3 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMC4Q9NTJ3 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMC4Q9NTJ3 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMC4Q9NTJ3 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMC4Q9NTJ3 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMC4Q9NTJ3 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMC4Q9NTJ3 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMC4Q9NTJ3 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMC4Q9NTJ3 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMC4Q9NTJ3 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMC4Q9NTJ3 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMC4Q9NTJ3 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMC4Q9NTJ3 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMC4Q9NTJ3 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMC4Q9NTJ3 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMC4Q9NTJ3 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMC4Q9NTJ3 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMC4Q9NTJ3 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMC4Q9NTJ3 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMC4Q9NTJ3 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMC4Q9NTJ3 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMC4Q9NTJ3 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMC4Q9NTJ3 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMC4Q9NTJ3 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMC4Q9NTJ3 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMC4Q9NTJ3 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMC4Q9NTJ3 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SMC4Q9NTJ3 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMC4Q9NTJ3 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMC4Q9NTJ3 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMC4Q9NTJ3 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMC4Q9NTJ3 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMC4Q9NTJ3 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMC4Q9NTJ3 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMC4Q9NTJ3 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMC4Q9NTJ3 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMC4Q9NTJ3 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMC4Q9NTJ3 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMC4Q9NTJ3 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMC4Q9NTJ3 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMC4Q9NTJ3 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMC4Q9NTJ3 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMC4Q9NTJ3 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMC4Q9NTJ3 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMC4Q9NTJ3 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMC4Q9NTJ3 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMC4Q9NTJ3 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMC4Q9NTJ3 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMC4Q9NTJ3 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMC4Q9NTJ3 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMC4Q9NTJ3 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMC4Q9NTJ3 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SMC4Q9NTJ3 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMC4Q9NTJ3 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMC4Q9NTJ3 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMC4Q9NTJ3 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMC4Q9NTJ3 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMC4Q9NTJ3 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMC4Q9NTJ3 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMC4Q9NTJ3 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMC4Q9NTJ3 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMC4Q9NTJ3 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMC4Q9NTJ3 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMC4Q9NTJ3 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMC4Q9NTJ3 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMC4Q9NTJ3 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMC4Q9NTJ3 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMC4Q9NTJ3 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SMC4Q9NTJ3 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SMC4Q9NTJ3 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMC4Q9NTJ3 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMC4Q9NTJ3 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMC4Q9NTJ3 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMC4Q9NTJ3 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMC4Q9NTJ3 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMC4Q9NTJ3 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMC4Q9NTJ3 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMC4Q9NTJ3 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMC4Q9NTJ3 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMC4Q9NTJ3 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMC4Q9NTJ3 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMC4Q9NTJ3 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMC4Q9NTJ3 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMC4Q9NTJ3 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMC4Q9NTJ3 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMC4Q9NTJ3 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMC4Q9NTJ3 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMC4Q9NTJ3 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMC4Q9NTJ3 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMC4Q9NTJ3 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMC4Q9NTJ3 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMC4Q9NTJ3 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMC4Q9NTJ3 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMC4Q9NTJ3 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMC4Q9NTJ3 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMC4Q9NTJ3 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMC4Q9NTJ3 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMC4Q9NTJ3 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMC4Q9NTJ3 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms