Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CENPMQ9NSP4 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms