Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS93

TM7SF3, Transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3Q9NS93 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TM7SF3Q9NS93 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
TM7SF3Q9NS93 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TM7SF3Q9NS93 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TM7SF3Q9NS93 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TM7SF3Q9NS93 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TM7SF3Q9NS93 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TM7SF3Q9NS93 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TM7SF3Q9NS93 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TM7SF3Q9NS93 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TM7SF3Q9NS93 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TM7SF3Q9NS93 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TM7SF3Q9NS93 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TM7SF3Q9NS93 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TM7SF3Q9NS93 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TM7SF3Q9NS93 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TM7SF3Q9NS93 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TM7SF3Q9NS93 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TM7SF3Q9NS93 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TM7SF3Q9NS93 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TM7SF3Q9NS93 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TM7SF3Q9NS93 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TM7SF3Q9NS93 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TM7SF3Q9NS93 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TM7SF3Q9NS93 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TM7SF3Q9NS93 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TM7SF3Q9NS93 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TM7SF3Q9NS93 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TM7SF3Q9NS93 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TM7SF3Q9NS93 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TM7SF3Q9NS93 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TM7SF3Q9NS93 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TM7SF3Q9NS93 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TM7SF3Q9NS93 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TM7SF3Q9NS93 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TM7SF3Q9NS93 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TM7SF3Q9NS93 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TM7SF3Q9NS93 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TM7SF3Q9NS93 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TM7SF3Q9NS93 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TM7SF3Q9NS93 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TM7SF3Q9NS93 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TM7SF3Q9NS93 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TM7SF3Q9NS93 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TM7SF3Q9NS93 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TM7SF3Q9NS93 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TM7SF3Q9NS93 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TM7SF3Q9NS93 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TM7SF3Q9NS93 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TM7SF3Q9NS93 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TM7SF3Q9NS93 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TM7SF3Q9NS93 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TM7SF3Q9NS93 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TM7SF3Q9NS93 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TM7SF3Q9NS93 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TM7SF3Q9NS93 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TM7SF3Q9NS93 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TM7SF3Q9NS93 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TM7SF3Q9NS93 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TM7SF3Q9NS93 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TM7SF3Q9NS93 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TM7SF3Q9NS93 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TM7SF3Q9NS93 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TM7SF3Q9NS93 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TM7SF3Q9NS93 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TM7SF3Q9NS93 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TM7SF3Q9NS93 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TM7SF3Q9NS93 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TM7SF3Q9NS93 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TM7SF3Q9NS93 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TM7SF3Q9NS93 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TM7SF3Q9NS93 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TM7SF3Q9NS93 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TM7SF3Q9NS93 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TM7SF3Q9NS93 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TM7SF3Q9NS93 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TM7SF3Q9NS93 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TM7SF3Q9NS93 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TM7SF3Q9NS93 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TM7SF3Q9NS93 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TM7SF3Q9NS93 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TM7SF3Q9NS93 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TM7SF3Q9NS93 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TM7SF3Q9NS93 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TM7SF3Q9NS93 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TM7SF3Q9NS93 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TM7SF3Q9NS93 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TM7SF3Q9NS93 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TM7SF3Q9NS93 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TM7SF3Q9NS93 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TM7SF3Q9NS93 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TM7SF3Q9NS93 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TM7SF3Q9NS93 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TM7SF3Q9NS93 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TM7SF3Q9NS93 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TM7SF3Q9NS93 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TM7SF3Q9NS93 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TM7SF3Q9NS93 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TM7SF3Q9NS93 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TM7SF3Q9NS93 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms