Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW7

VPS45, Vacuolar protein sorting-associated protein 45, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS45Q9NRW7 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VPS45Q9NRW7 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
VPS45Q9NRW7 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VPS45Q9NRW7 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
VPS45Q9NRW7 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VPS45Q9NRW7 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VPS45Q9NRW7 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VPS45Q9NRW7 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VPS45Q9NRW7 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VPS45Q9NRW7 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VPS45Q9NRW7 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VPS45Q9NRW7 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
VPS45Q9NRW7 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
VPS45Q9NRW7 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
VPS45Q9NRW7 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
VPS45Q9NRW7 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
VPS45Q9NRW7 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VPS45Q9NRW7 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VPS45Q9NRW7 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VPS45Q9NRW7 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
VPS45Q9NRW7 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
VPS45Q9NRW7 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VPS45Q9NRW7 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VPS45Q9NRW7 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VPS45Q9NRW7 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
VPS45Q9NRW7 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VPS45Q9NRW7 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VPS45Q9NRW7 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VPS45Q9NRW7 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VPS45Q9NRW7 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VPS45Q9NRW7 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VPS45Q9NRW7 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
VPS45Q9NRW7 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VPS45Q9NRW7 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
VPS45Q9NRW7 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VPS45Q9NRW7 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VPS45Q9NRW7 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
VPS45Q9NRW7 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
VPS45Q9NRW7 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
VPS45Q9NRW7 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
VPS45Q9NRW7 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VPS45Q9NRW7 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VPS45Q9NRW7 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VPS45Q9NRW7 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VPS45Q9NRW7 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VPS45Q9NRW7 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
VPS45Q9NRW7 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VPS45Q9NRW7 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VPS45Q9NRW7 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VPS45Q9NRW7 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VPS45Q9NRW7 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VPS45Q9NRW7 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VPS45Q9NRW7 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VPS45Q9NRW7 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VPS45Q9NRW7 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
VPS45Q9NRW7 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
VPS45Q9NRW7 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VPS45Q9NRW7 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
VPS45Q9NRW7 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
VPS45Q9NRW7 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VPS45Q9NRW7 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VPS45Q9NRW7 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VPS45Q9NRW7 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
VPS45Q9NRW7 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VPS45Q9NRW7 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
VPS45Q9NRW7 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VPS45Q9NRW7 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VPS45Q9NRW7 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
VPS45Q9NRW7 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VPS45Q9NRW7 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
VPS45Q9NRW7 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VPS45Q9NRW7 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
VPS45Q9NRW7 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
VPS45Q9NRW7 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VPS45Q9NRW7 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VPS45Q9NRW7 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VPS45Q9NRW7 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
VPS45Q9NRW7 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VPS45Q9NRW7 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
VPS45Q9NRW7 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
VPS45Q9NRW7 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VPS45Q9NRW7 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
VPS45Q9NRW7 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VPS45Q9NRW7 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
VPS45Q9NRW7 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
VPS45Q9NRW7 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
VPS45Q9NRW7 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
VPS45Q9NRW7 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
VPS45Q9NRW7 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
VPS45Q9NRW7 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
VPS45Q9NRW7 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
VPS45Q9NRW7 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VPS45Q9NRW7 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
VPS45Q9NRW7 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VPS45Q9NRW7 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VPS45Q9NRW7 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VPS45Q9NRW7 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
VPS45Q9NRW7 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
VPS45Q9NRW7 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VPS45Q9NRW7 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms