Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRL3

STRN4, Striatin-4, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN4Q9NRL3 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
STRN4Q9NRL3 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
STRN4Q9NRL3 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
STRN4Q9NRL3 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
STRN4Q9NRL3 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
STRN4Q9NRL3 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
STRN4Q9NRL3 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
STRN4Q9NRL3 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
STRN4Q9NRL3 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
STRN4Q9NRL3 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
STRN4Q9NRL3 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
STRN4Q9NRL3 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
STRN4Q9NRL3 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
STRN4Q9NRL3 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
STRN4Q9NRL3 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
STRN4Q9NRL3 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
STRN4Q9NRL3 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
STRN4Q9NRL3 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
STRN4Q9NRL3 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
STRN4Q9NRL3 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
STRN4Q9NRL3 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
STRN4Q9NRL3 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
STRN4Q9NRL3 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
STRN4Q9NRL3 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
STRN4Q9NRL3 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
STRN4Q9NRL3 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
STRN4Q9NRL3 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
STRN4Q9NRL3 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
STRN4Q9NRL3 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
STRN4Q9NRL3 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
STRN4Q9NRL3 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
STRN4Q9NRL3 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
STRN4Q9NRL3 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
STRN4Q9NRL3 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
STRN4Q9NRL3 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
STRN4Q9NRL3 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
STRN4Q9NRL3 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
STRN4Q9NRL3 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
STRN4Q9NRL3 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
STRN4Q9NRL3 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
STRN4Q9NRL3 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
STRN4Q9NRL3 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
STRN4Q9NRL3 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
STRN4Q9NRL3 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
STRN4Q9NRL3 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
STRN4Q9NRL3 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
STRN4Q9NRL3 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
STRN4Q9NRL3 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
STRN4Q9NRL3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
STRN4Q9NRL3 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
STRN4Q9NRL3 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
STRN4Q9NRL3 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
STRN4Q9NRL3 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
STRN4Q9NRL3 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
STRN4Q9NRL3 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
STRN4Q9NRL3 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
STRN4Q9NRL3 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
STRN4Q9NRL3 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
STRN4Q9NRL3 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
STRN4Q9NRL3 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
STRN4Q9NRL3 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
STRN4Q9NRL3 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
STRN4Q9NRL3 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
STRN4Q9NRL3 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
STRN4Q9NRL3 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
STRN4Q9NRL3 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
STRN4Q9NRL3 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
STRN4Q9NRL3 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
STRN4Q9NRL3 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
STRN4Q9NRL3 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
STRN4Q9NRL3 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
STRN4Q9NRL3 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
STRN4Q9NRL3 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
STRN4Q9NRL3 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
STRN4Q9NRL3 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
STRN4Q9NRL3 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
STRN4Q9NRL3 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
STRN4Q9NRL3 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
STRN4Q9NRL3 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
STRN4Q9NRL3 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
STRN4Q9NRL3 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
STRN4Q9NRL3 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
STRN4Q9NRL3 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
STRN4Q9NRL3 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
STRN4Q9NRL3 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
STRN4Q9NRL3 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
STRN4Q9NRL3 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
STRN4Q9NRL3 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
STRN4Q9NRL3 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
STRN4Q9NRL3 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
STRN4Q9NRL3 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
STRN4Q9NRL3 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
STRN4Q9NRL3 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
STRN4Q9NRL3 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
STRN4Q9NRL3 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
STRN4Q9NRL3 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
STRN4Q9NRL3 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
STRN4Q9NRL3 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
STRN4Q9NRL3 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
STRN4Q9NRL3 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms