Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC97

GPR35, G-protein coupled receptor 35, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR35Q9HC97 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPR35Q9HC97 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPR35Q9HC97 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPR35Q9HC97 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPR35Q9HC97 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPR35Q9HC97 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPR35Q9HC97 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPR35Q9HC97 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPR35Q9HC97 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GPR35Q9HC97 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPR35Q9HC97 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPR35Q9HC97 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPR35Q9HC97 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPR35Q9HC97 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPR35Q9HC97 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPR35Q9HC97 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GPR35Q9HC97 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPR35Q9HC97 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPR35Q9HC97 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPR35Q9HC97 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPR35Q9HC97 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPR35Q9HC97 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPR35Q9HC97 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPR35Q9HC97 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPR35Q9HC97 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPR35Q9HC97 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPR35Q9HC97 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPR35Q9HC97 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPR35Q9HC97 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPR35Q9HC97 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPR35Q9HC97 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPR35Q9HC97 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPR35Q9HC97 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPR35Q9HC97 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPR35Q9HC97 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPR35Q9HC97 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPR35Q9HC97 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPR35Q9HC97 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GPR35Q9HC97 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPR35Q9HC97 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GPR35Q9HC97 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GPR35Q9HC97 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPR35Q9HC97 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPR35Q9HC97 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GPR35Q9HC97 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPR35Q9HC97 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPR35Q9HC97 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPR35Q9HC97 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPR35Q9HC97 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPR35Q9HC97 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPR35Q9HC97 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPR35Q9HC97 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPR35Q9HC97 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPR35Q9HC97 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPR35Q9HC97 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPR35Q9HC97 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPR35Q9HC97 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPR35Q9HC97 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPR35Q9HC97 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPR35Q9HC97 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPR35Q9HC97 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPR35Q9HC97 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPR35Q9HC97 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPR35Q9HC97 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPR35Q9HC97 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPR35Q9HC97 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPR35Q9HC97 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPR35Q9HC97 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPR35Q9HC97 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPR35Q9HC97 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPR35Q9HC97 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPR35Q9HC97 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPR35Q9HC97 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPR35Q9HC97 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPR35Q9HC97 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPR35Q9HC97 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPR35Q9HC97 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPR35Q9HC97 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPR35Q9HC97 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPR35Q9HC97 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPR35Q9HC97 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPR35Q9HC97 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GPR35Q9HC97 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GPR35Q9HC97 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPR35Q9HC97 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPR35Q9HC97 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPR35Q9HC97 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPR35Q9HC97 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPR35Q9HC97 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPR35Q9HC97 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPR35Q9HC97 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPR35Q9HC97 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPR35Q9HC97 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPR35Q9HC97 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPR35Q9HC97 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPR35Q9HC97 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPR35Q9HC97 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPR35Q9HC97 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPR35Q9HC97 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPR35Q9HC97 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.5 ms