Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU5

NYX, Nyctalopin, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NYXQ9GZU5 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NYXQ9GZU5 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NYXQ9GZU5 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NYXQ9GZU5 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
NYXQ9GZU5 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NYXQ9GZU5 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NYXQ9GZU5 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NYXQ9GZU5 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NYXQ9GZU5 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NYXQ9GZU5 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NYXQ9GZU5 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NYXQ9GZU5 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NYXQ9GZU5 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NYXQ9GZU5 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NYXQ9GZU5 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NYXQ9GZU5 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NYXQ9GZU5 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NYXQ9GZU5 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NYXQ9GZU5 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NYXQ9GZU5 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NYXQ9GZU5 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NYXQ9GZU5 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NYXQ9GZU5 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NYXQ9GZU5 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NYXQ9GZU5 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NYXQ9GZU5 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NYXQ9GZU5 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NYXQ9GZU5 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NYXQ9GZU5 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NYXQ9GZU5 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NYXQ9GZU5 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NYXQ9GZU5 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NYXQ9GZU5 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NYXQ9GZU5 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NYXQ9GZU5 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NYXQ9GZU5 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
NYXQ9GZU5 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NYXQ9GZU5 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NYXQ9GZU5 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
NYXQ9GZU5 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NYXQ9GZU5 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NYXQ9GZU5 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NYXQ9GZU5 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NYXQ9GZU5 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NYXQ9GZU5 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NYXQ9GZU5 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NYXQ9GZU5 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NYXQ9GZU5 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NYXQ9GZU5 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NYXQ9GZU5 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NYXQ9GZU5 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NYXQ9GZU5 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NYXQ9GZU5 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NYXQ9GZU5 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NYXQ9GZU5 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NYXQ9GZU5 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NYXQ9GZU5 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NYXQ9GZU5 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NYXQ9GZU5 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NYXQ9GZU5 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NYXQ9GZU5 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NYXQ9GZU5 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NYXQ9GZU5 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NYXQ9GZU5 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NYXQ9GZU5 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NYXQ9GZU5 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NYXQ9GZU5 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NYXQ9GZU5 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NYXQ9GZU5 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NYXQ9GZU5 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NYXQ9GZU5 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NYXQ9GZU5 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NYXQ9GZU5 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NYXQ9GZU5 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NYXQ9GZU5 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NYXQ9GZU5 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NYXQ9GZU5 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NYXQ9GZU5 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NYXQ9GZU5 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NYXQ9GZU5 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NYXQ9GZU5 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NYXQ9GZU5 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NYXQ9GZU5 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NYXQ9GZU5 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NYXQ9GZU5 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NYXQ9GZU5 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NYXQ9GZU5 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NYXQ9GZU5 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NYXQ9GZU5 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NYXQ9GZU5 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NYXQ9GZU5 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NYXQ9GZU5 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NYXQ9GZU5 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NYXQ9GZU5 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NYXQ9GZU5 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NYXQ9GZU5 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NYXQ9GZU5 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NYXQ9GZU5 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NYXQ9GZU5 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NYXQ9GZU5 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms