Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT6

CCDC90B, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC90BQ9GZT6 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms