Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV7

BCO2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCO2Q9BYV7 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BCO2Q9BYV7 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BCO2Q9BYV7 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BCO2Q9BYV7 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
BCO2Q9BYV7 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
BCO2Q9BYV7 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
BCO2Q9BYV7 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
BCO2Q9BYV7 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BCO2Q9BYV7 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BCO2Q9BYV7 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BCO2Q9BYV7 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
BCO2Q9BYV7 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BCO2Q9BYV7 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
BCO2Q9BYV7 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
BCO2Q9BYV7 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BCO2Q9BYV7 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
BCO2Q9BYV7 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BCO2Q9BYV7 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
BCO2Q9BYV7 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
BCO2Q9BYV7 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BCO2Q9BYV7 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
BCO2Q9BYV7 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
BCO2Q9BYV7 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BCO2Q9BYV7 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
BCO2Q9BYV7 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BCO2Q9BYV7 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BCO2Q9BYV7 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BCO2Q9BYV7 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BCO2Q9BYV7 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BCO2Q9BYV7 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
BCO2Q9BYV7 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BCO2Q9BYV7 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
BCO2Q9BYV7 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
BCO2Q9BYV7 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
BCO2Q9BYV7 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BCO2Q9BYV7 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BCO2Q9BYV7 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BCO2Q9BYV7 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
BCO2Q9BYV7 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
BCO2Q9BYV7 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BCO2Q9BYV7 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
BCO2Q9BYV7 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
BCO2Q9BYV7 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
BCO2Q9BYV7 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
BCO2Q9BYV7 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
BCO2Q9BYV7 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BCO2Q9BYV7 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BCO2Q9BYV7 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
BCO2Q9BYV7 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BCO2Q9BYV7 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
BCO2Q9BYV7 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BCO2Q9BYV7 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
BCO2Q9BYV7 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BCO2Q9BYV7 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
BCO2Q9BYV7 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
BCO2Q9BYV7 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
BCO2Q9BYV7 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BCO2Q9BYV7 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BCO2Q9BYV7 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BCO2Q9BYV7 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BCO2Q9BYV7 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BCO2Q9BYV7 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BCO2Q9BYV7 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BCO2Q9BYV7 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BCO2Q9BYV7 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BCO2Q9BYV7 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BCO2Q9BYV7 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BCO2Q9BYV7 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
BCO2Q9BYV7 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BCO2Q9BYV7 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BCO2Q9BYV7 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
BCO2Q9BYV7 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
BCO2Q9BYV7 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BCO2Q9BYV7 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BCO2Q9BYV7 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BCO2Q9BYV7 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BCO2Q9BYV7 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BCO2Q9BYV7 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BCO2Q9BYV7 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BCO2Q9BYV7 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BCO2Q9BYV7 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BCO2Q9BYV7 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
BCO2Q9BYV7 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BCO2Q9BYV7 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BCO2Q9BYV7 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BCO2Q9BYV7 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BCO2Q9BYV7 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
BCO2Q9BYV7 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
BCO2Q9BYV7 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BCO2Q9BYV7 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BCO2Q9BYV7 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BCO2Q9BYV7 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
BCO2Q9BYV7 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BCO2Q9BYV7 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BCO2Q9BYV7 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BCO2Q9BYV7 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
BCO2Q9BYV7 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BCO2Q9BYV7 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BCO2Q9BYV7 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
BCO2Q9BYV7 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.8 ms