Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms