Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT2

CACNG6, Voltage-dependent calcium channel gamma-6 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG6Q9BXT2 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNG6Q9BXT2 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNG6Q9BXT2 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNG6Q9BXT2 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNG6Q9BXT2 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNG6Q9BXT2 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNG6Q9BXT2 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNG6Q9BXT2 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNG6Q9BXT2 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNG6Q9BXT2 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNG6Q9BXT2 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNG6Q9BXT2 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNG6Q9BXT2 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNG6Q9BXT2 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNG6Q9BXT2 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNG6Q9BXT2 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNG6Q9BXT2 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNG6Q9BXT2 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNG6Q9BXT2 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNG6Q9BXT2 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNG6Q9BXT2 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNG6Q9BXT2 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNG6Q9BXT2 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNG6Q9BXT2 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNG6Q9BXT2 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNG6Q9BXT2 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNG6Q9BXT2 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNG6Q9BXT2 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNG6Q9BXT2 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNG6Q9BXT2 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNG6Q9BXT2 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNG6Q9BXT2 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNG6Q9BXT2 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNG6Q9BXT2 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNG6Q9BXT2 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNG6Q9BXT2 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNG6Q9BXT2 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNG6Q9BXT2 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNG6Q9BXT2 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNG6Q9BXT2 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNG6Q9BXT2 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNG6Q9BXT2 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNG6Q9BXT2 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNG6Q9BXT2 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CACNG6Q9BXT2 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CACNG6Q9BXT2 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CACNG6Q9BXT2 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CACNG6Q9BXT2 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CACNG6Q9BXT2 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CACNG6Q9BXT2 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CACNG6Q9BXT2 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNG6Q9BXT2 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNG6Q9BXT2 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNG6Q9BXT2 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNG6Q9BXT2 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNG6Q9BXT2 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNG6Q9BXT2 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNG6Q9BXT2 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNG6Q9BXT2 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNG6Q9BXT2 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNG6Q9BXT2 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNG6Q9BXT2 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNG6Q9BXT2 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNG6Q9BXT2 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNG6Q9BXT2 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNG6Q9BXT2 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNG6Q9BXT2 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNG6Q9BXT2 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNG6Q9BXT2 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNG6Q9BXT2 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNG6Q9BXT2 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNG6Q9BXT2 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNG6Q9BXT2 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNG6Q9BXT2 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNG6Q9BXT2 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNG6Q9BXT2 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNG6Q9BXT2 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNG6Q9BXT2 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNG6Q9BXT2 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNG6Q9BXT2 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNG6Q9BXT2 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNG6Q9BXT2 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNG6Q9BXT2 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNG6Q9BXT2 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNG6Q9BXT2 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNG6Q9BXT2 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNG6Q9BXT2 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNG6Q9BXT2 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNG6Q9BXT2 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNG6Q9BXT2 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNG6Q9BXT2 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNG6Q9BXT2 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNG6Q9BXT2 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNG6Q9BXT2 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNG6Q9BXT2 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNG6Q9BXT2 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNG6Q9BXT2 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNG6Q9BXT2 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNG6Q9BXT2 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNG6Q9BXT2 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms