Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB11FIP5Q9BXF6 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms