Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUZ4

TRAF4, TNF receptor-associated factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF4Q9BUZ4 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAF4Q9BUZ4 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAF4Q9BUZ4 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAF4Q9BUZ4 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAF4Q9BUZ4 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAF4Q9BUZ4 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAF4Q9BUZ4 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAF4Q9BUZ4 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAF4Q9BUZ4 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAF4Q9BUZ4 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAF4Q9BUZ4 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAF4Q9BUZ4 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAF4Q9BUZ4 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAF4Q9BUZ4 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAF4Q9BUZ4 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAF4Q9BUZ4 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAF4Q9BUZ4 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAF4Q9BUZ4 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAF4Q9BUZ4 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAF4Q9BUZ4 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAF4Q9BUZ4 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAF4Q9BUZ4 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAF4Q9BUZ4 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAF4Q9BUZ4 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAF4Q9BUZ4 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAF4Q9BUZ4 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAF4Q9BUZ4 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAF4Q9BUZ4 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAF4Q9BUZ4 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAF4Q9BUZ4 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAF4Q9BUZ4 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAF4Q9BUZ4 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAF4Q9BUZ4 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAF4Q9BUZ4 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAF4Q9BUZ4 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAF4Q9BUZ4 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAF4Q9BUZ4 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAF4Q9BUZ4 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAF4Q9BUZ4 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAF4Q9BUZ4 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAF4Q9BUZ4 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAF4Q9BUZ4 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAF4Q9BUZ4 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAF4Q9BUZ4 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAF4Q9BUZ4 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAF4Q9BUZ4 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAF4Q9BUZ4 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAF4Q9BUZ4 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAF4Q9BUZ4 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAF4Q9BUZ4 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAF4Q9BUZ4 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAF4Q9BUZ4 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAF4Q9BUZ4 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAF4Q9BUZ4 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAF4Q9BUZ4 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAF4Q9BUZ4 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAF4Q9BUZ4 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAF4Q9BUZ4 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAF4Q9BUZ4 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAF4Q9BUZ4 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAF4Q9BUZ4 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAF4Q9BUZ4 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAF4Q9BUZ4 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAF4Q9BUZ4 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAF4Q9BUZ4 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAF4Q9BUZ4 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAF4Q9BUZ4 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAF4Q9BUZ4 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAF4Q9BUZ4 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAF4Q9BUZ4 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAF4Q9BUZ4 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAF4Q9BUZ4 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAF4Q9BUZ4 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAF4Q9BUZ4 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAF4Q9BUZ4 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAF4Q9BUZ4 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAF4Q9BUZ4 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAF4Q9BUZ4 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAF4Q9BUZ4 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAF4Q9BUZ4 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAF4Q9BUZ4 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAF4Q9BUZ4 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAF4Q9BUZ4 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAF4Q9BUZ4 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAF4Q9BUZ4 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAF4Q9BUZ4 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAF4Q9BUZ4 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAF4Q9BUZ4 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAF4Q9BUZ4 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAF4Q9BUZ4 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAF4Q9BUZ4 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAF4Q9BUZ4 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAF4Q9BUZ4 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAF4Q9BUZ4 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAF4Q9BUZ4 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAF4Q9BUZ4 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAF4Q9BUZ4 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAF4Q9BUZ4 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAF4Q9BUZ4 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAF4Q9BUZ4 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms