Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTF0

THUMPD2, THUMP domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD2Q9BTF0 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
THUMPD2Q9BTF0 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
THUMPD2Q9BTF0 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
THUMPD2Q9BTF0 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
THUMPD2Q9BTF0 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
THUMPD2Q9BTF0 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
THUMPD2Q9BTF0 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
THUMPD2Q9BTF0 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
THUMPD2Q9BTF0 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
THUMPD2Q9BTF0 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
THUMPD2Q9BTF0 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
THUMPD2Q9BTF0 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
THUMPD2Q9BTF0 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
THUMPD2Q9BTF0 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
THUMPD2Q9BTF0 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
THUMPD2Q9BTF0 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
THUMPD2Q9BTF0 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
THUMPD2Q9BTF0 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
THUMPD2Q9BTF0 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
THUMPD2Q9BTF0 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
THUMPD2Q9BTF0 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
THUMPD2Q9BTF0 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
THUMPD2Q9BTF0 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
THUMPD2Q9BTF0 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
THUMPD2Q9BTF0 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
THUMPD2Q9BTF0 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
THUMPD2Q9BTF0 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
THUMPD2Q9BTF0 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
THUMPD2Q9BTF0 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
THUMPD2Q9BTF0 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
THUMPD2Q9BTF0 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
THUMPD2Q9BTF0 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
THUMPD2Q9BTF0 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
THUMPD2Q9BTF0 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
THUMPD2Q9BTF0 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
THUMPD2Q9BTF0 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
THUMPD2Q9BTF0 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
THUMPD2Q9BTF0 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
THUMPD2Q9BTF0 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
THUMPD2Q9BTF0 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
THUMPD2Q9BTF0 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
THUMPD2Q9BTF0 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
THUMPD2Q9BTF0 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
THUMPD2Q9BTF0 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
THUMPD2Q9BTF0 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
THUMPD2Q9BTF0 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
THUMPD2Q9BTF0 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
THUMPD2Q9BTF0 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
THUMPD2Q9BTF0 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
THUMPD2Q9BTF0 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
THUMPD2Q9BTF0 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
THUMPD2Q9BTF0 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
THUMPD2Q9BTF0 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
THUMPD2Q9BTF0 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
THUMPD2Q9BTF0 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
THUMPD2Q9BTF0 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
THUMPD2Q9BTF0 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
THUMPD2Q9BTF0 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
THUMPD2Q9BTF0 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
THUMPD2Q9BTF0 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
THUMPD2Q9BTF0 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
THUMPD2Q9BTF0 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
THUMPD2Q9BTF0 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
THUMPD2Q9BTF0 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
THUMPD2Q9BTF0 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
THUMPD2Q9BTF0 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
THUMPD2Q9BTF0 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
THUMPD2Q9BTF0 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
THUMPD2Q9BTF0 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
THUMPD2Q9BTF0 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
THUMPD2Q9BTF0 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
THUMPD2Q9BTF0 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
THUMPD2Q9BTF0 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
THUMPD2Q9BTF0 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
THUMPD2Q9BTF0 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
THUMPD2Q9BTF0 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
THUMPD2Q9BTF0 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
THUMPD2Q9BTF0 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
THUMPD2Q9BTF0 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
THUMPD2Q9BTF0 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
THUMPD2Q9BTF0 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
THUMPD2Q9BTF0 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
THUMPD2Q9BTF0 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
THUMPD2Q9BTF0 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
THUMPD2Q9BTF0 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
THUMPD2Q9BTF0 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
THUMPD2Q9BTF0 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
THUMPD2Q9BTF0 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
THUMPD2Q9BTF0 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
THUMPD2Q9BTF0 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
THUMPD2Q9BTF0 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
THUMPD2Q9BTF0 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
THUMPD2Q9BTF0 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
THUMPD2Q9BTF0 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
THUMPD2Q9BTF0 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
THUMPD2Q9BTF0 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
THUMPD2Q9BTF0 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
THUMPD2Q9BTF0 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
THUMPD2Q9BTF0 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
THUMPD2Q9BTF0 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms