Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT76

UPK3B, Uroplakin-3b, humanhuman

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Length 320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3BQ9BT76 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
UPK3BQ9BT76 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
UPK3BQ9BT76 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
UPK3BQ9BT76 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
UPK3BQ9BT76 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
UPK3BQ9BT76 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
UPK3BQ9BT76 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
UPK3BQ9BT76 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
UPK3BQ9BT76 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
UPK3BQ9BT76 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC13□□□□□ -0.33
UPK3BQ9BT76 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
UPK3BQ9BT76 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
UPK3BQ9BT76 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
UPK3BQ9BT76 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC13□□□□□ -0.33
UPK3BQ9BT76 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
UPK3BQ9BT76 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
UPK3BQ9BT76 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
UPK3BQ9BT76 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
UPK3BQ9BT76 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
UPK3BQ9BT76 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC13□□□□□ -0.33
UPK3BQ9BT76 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
UPK3BQ9BT76 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
UPK3BQ9BT76 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
UPK3BQ9BT76 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
UPK3BQ9BT76 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
UPK3BQ9BT76 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
UPK3BQ9BT76 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
UPK3BQ9BT76 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
UPK3BQ9BT76 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
UPK3BQ9BT76 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
UPK3BQ9BT76 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
UPK3BQ9BT76 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
UPK3BQ9BT76 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
UPK3BQ9BT76 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
UPK3BQ9BT76 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
UPK3BQ9BT76 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
UPK3BQ9BT76 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
UPK3BQ9BT76 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
UPK3BQ9BT76 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
UPK3BQ9BT76 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
UPK3BQ9BT76 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
UPK3BQ9BT76 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
UPK3BQ9BT76 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
UPK3BQ9BT76 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
UPK3BQ9BT76 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
UPK3BQ9BT76 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
UPK3BQ9BT76 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
UPK3BQ9BT76 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
UPK3BQ9BT76 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
UPK3BQ9BT76 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
UPK3BQ9BT76 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
UPK3BQ9BT76 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
UPK3BQ9BT76 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.99□□□□□ -0.33
UPK3BQ9BT76 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
UPK3BQ9BT76 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
UPK3BQ9BT76 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
UPK3BQ9BT76 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
UPK3BQ9BT76 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
UPK3BQ9BT76 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC12.99□□□□□ -0.33
UPK3BQ9BT76 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
UPK3BQ9BT76 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
UPK3BQ9BT76 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
UPK3BQ9BT76 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
UPK3BQ9BT76 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
UPK3BQ9BT76 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
UPK3BQ9BT76 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
UPK3BQ9BT76 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
UPK3BQ9BT76 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
UPK3BQ9BT76 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
UPK3BQ9BT76 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
UPK3BQ9BT76 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
UPK3BQ9BT76 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
UPK3BQ9BT76 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
UPK3BQ9BT76 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
UPK3BQ9BT76 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
UPK3BQ9BT76 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
UPK3BQ9BT76 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
UPK3BQ9BT76 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
UPK3BQ9BT76 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
UPK3BQ9BT76 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
UPK3BQ9BT76 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
UPK3BQ9BT76 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
UPK3BQ9BT76 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
UPK3BQ9BT76 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
UPK3BQ9BT76 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
UPK3BQ9BT76 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
UPK3BQ9BT76 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
UPK3BQ9BT76 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
UPK3BQ9BT76 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
UPK3BQ9BT76 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
UPK3BQ9BT76 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
UPK3BQ9BT76 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
UPK3BQ9BT76 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
UPK3BQ9BT76 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC12.98□□□□□ -0.33
UPK3BQ9BT76 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
UPK3BQ9BT76 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
UPK3BQ9BT76 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
UPK3BQ9BT76 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
UPK3BQ9BT76 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
UPK3BQ9BT76 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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