Protein–RNA interactions for Protein: Q9BS16

CENPK, Centromere protein K, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPKQ9BS16 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPKQ9BS16 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPKQ9BS16 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPKQ9BS16 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPKQ9BS16 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPKQ9BS16 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPKQ9BS16 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPKQ9BS16 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPKQ9BS16 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPKQ9BS16 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPKQ9BS16 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPKQ9BS16 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPKQ9BS16 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPKQ9BS16 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPKQ9BS16 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPKQ9BS16 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPKQ9BS16 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPKQ9BS16 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPKQ9BS16 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPKQ9BS16 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPKQ9BS16 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPKQ9BS16 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPKQ9BS16 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPKQ9BS16 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPKQ9BS16 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPKQ9BS16 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPKQ9BS16 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPKQ9BS16 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPKQ9BS16 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPKQ9BS16 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPKQ9BS16 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPKQ9BS16 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPKQ9BS16 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPKQ9BS16 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPKQ9BS16 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPKQ9BS16 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPKQ9BS16 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPKQ9BS16 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPKQ9BS16 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPKQ9BS16 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPKQ9BS16 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPKQ9BS16 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPKQ9BS16 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPKQ9BS16 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPKQ9BS16 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPKQ9BS16 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPKQ9BS16 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPKQ9BS16 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPKQ9BS16 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPKQ9BS16 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPKQ9BS16 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPKQ9BS16 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPKQ9BS16 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPKQ9BS16 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPKQ9BS16 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPKQ9BS16 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPKQ9BS16 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPKQ9BS16 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPKQ9BS16 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPKQ9BS16 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPKQ9BS16 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPKQ9BS16 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPKQ9BS16 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPKQ9BS16 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPKQ9BS16 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPKQ9BS16 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPKQ9BS16 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPKQ9BS16 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPKQ9BS16 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPKQ9BS16 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPKQ9BS16 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPKQ9BS16 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPKQ9BS16 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPKQ9BS16 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPKQ9BS16 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPKQ9BS16 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPKQ9BS16 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPKQ9BS16 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPKQ9BS16 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPKQ9BS16 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPKQ9BS16 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPKQ9BS16 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPKQ9BS16 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPKQ9BS16 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPKQ9BS16 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPKQ9BS16 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPKQ9BS16 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPKQ9BS16 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPKQ9BS16 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPKQ9BS16 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPKQ9BS16 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPKQ9BS16 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPKQ9BS16 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPKQ9BS16 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPKQ9BS16 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPKQ9BS16 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPKQ9BS16 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPKQ9BS16 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPKQ9BS16 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPKQ9BS16 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms