Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR84

ZNF559, Zinc finger protein 559, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF559Q9BR84 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF559Q9BR84 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF559Q9BR84 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF559Q9BR84 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF559Q9BR84 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF559Q9BR84 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF559Q9BR84 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF559Q9BR84 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF559Q9BR84 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF559Q9BR84 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF559Q9BR84 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF559Q9BR84 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF559Q9BR84 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF559Q9BR84 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF559Q9BR84 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF559Q9BR84 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF559Q9BR84 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF559Q9BR84 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF559Q9BR84 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF559Q9BR84 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF559Q9BR84 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF559Q9BR84 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF559Q9BR84 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF559Q9BR84 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF559Q9BR84 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF559Q9BR84 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF559Q9BR84 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF559Q9BR84 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF559Q9BR84 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF559Q9BR84 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF559Q9BR84 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF559Q9BR84 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF559Q9BR84 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF559Q9BR84 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF559Q9BR84 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF559Q9BR84 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF559Q9BR84 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF559Q9BR84 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF559Q9BR84 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF559Q9BR84 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF559Q9BR84 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF559Q9BR84 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF559Q9BR84 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF559Q9BR84 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF559Q9BR84 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF559Q9BR84 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF559Q9BR84 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF559Q9BR84 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF559Q9BR84 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF559Q9BR84 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF559Q9BR84 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF559Q9BR84 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF559Q9BR84 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF559Q9BR84 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF559Q9BR84 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF559Q9BR84 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF559Q9BR84 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF559Q9BR84 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF559Q9BR84 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF559Q9BR84 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF559Q9BR84 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF559Q9BR84 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF559Q9BR84 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF559Q9BR84 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF559Q9BR84 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF559Q9BR84 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF559Q9BR84 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF559Q9BR84 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF559Q9BR84 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF559Q9BR84 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF559Q9BR84 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF559Q9BR84 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF559Q9BR84 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF559Q9BR84 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF559Q9BR84 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF559Q9BR84 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF559Q9BR84 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF559Q9BR84 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF559Q9BR84 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF559Q9BR84 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF559Q9BR84 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF559Q9BR84 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF559Q9BR84 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF559Q9BR84 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF559Q9BR84 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF559Q9BR84 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF559Q9BR84 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF559Q9BR84 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF559Q9BR84 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF559Q9BR84 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF559Q9BR84 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF559Q9BR84 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF559Q9BR84 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF559Q9BR84 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF559Q9BR84 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF559Q9BR84 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF559Q9BR84 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF559Q9BR84 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF559Q9BR84 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF559Q9BR84 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms