Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI6

SLF1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF1Q9BQI6 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLF1Q9BQI6 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLF1Q9BQI6 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLF1Q9BQI6 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLF1Q9BQI6 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLF1Q9BQI6 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLF1Q9BQI6 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLF1Q9BQI6 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLF1Q9BQI6 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLF1Q9BQI6 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLF1Q9BQI6 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLF1Q9BQI6 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SLF1Q9BQI6 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLF1Q9BQI6 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLF1Q9BQI6 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLF1Q9BQI6 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLF1Q9BQI6 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLF1Q9BQI6 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLF1Q9BQI6 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLF1Q9BQI6 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLF1Q9BQI6 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLF1Q9BQI6 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLF1Q9BQI6 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLF1Q9BQI6 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLF1Q9BQI6 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLF1Q9BQI6 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLF1Q9BQI6 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLF1Q9BQI6 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLF1Q9BQI6 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLF1Q9BQI6 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLF1Q9BQI6 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLF1Q9BQI6 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLF1Q9BQI6 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLF1Q9BQI6 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLF1Q9BQI6 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLF1Q9BQI6 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLF1Q9BQI6 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SLF1Q9BQI6 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLF1Q9BQI6 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SLF1Q9BQI6 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLF1Q9BQI6 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLF1Q9BQI6 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLF1Q9BQI6 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLF1Q9BQI6 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLF1Q9BQI6 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLF1Q9BQI6 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLF1Q9BQI6 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLF1Q9BQI6 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLF1Q9BQI6 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLF1Q9BQI6 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLF1Q9BQI6 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SLF1Q9BQI6 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLF1Q9BQI6 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLF1Q9BQI6 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLF1Q9BQI6 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLF1Q9BQI6 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SLF1Q9BQI6 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLF1Q9BQI6 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLF1Q9BQI6 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLF1Q9BQI6 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLF1Q9BQI6 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLF1Q9BQI6 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLF1Q9BQI6 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLF1Q9BQI6 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLF1Q9BQI6 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLF1Q9BQI6 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLF1Q9BQI6 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLF1Q9BQI6 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLF1Q9BQI6 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SLF1Q9BQI6 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLF1Q9BQI6 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SLF1Q9BQI6 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLF1Q9BQI6 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLF1Q9BQI6 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLF1Q9BQI6 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLF1Q9BQI6 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLF1Q9BQI6 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLF1Q9BQI6 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLF1Q9BQI6 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLF1Q9BQI6 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLF1Q9BQI6 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SLF1Q9BQI6 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLF1Q9BQI6 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLF1Q9BQI6 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SLF1Q9BQI6 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SLF1Q9BQI6 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLF1Q9BQI6 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SLF1Q9BQI6 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLF1Q9BQI6 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLF1Q9BQI6 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLF1Q9BQI6 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLF1Q9BQI6 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLF1Q9BQI6 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLF1Q9BQI6 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLF1Q9BQI6 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLF1Q9BQI6 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLF1Q9BQI6 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLF1Q9BQI6 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLF1Q9BQI6 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLF1Q9BQI6 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms