Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQD1

PMCHL2, Putative pro-MCH-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL2Q9BQD1 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PMCHL2Q9BQD1 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PMCHL2Q9BQD1 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PMCHL2Q9BQD1 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PMCHL2Q9BQD1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PMCHL2Q9BQD1 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PMCHL2Q9BQD1 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PMCHL2Q9BQD1 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PMCHL2Q9BQD1 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PMCHL2Q9BQD1 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PMCHL2Q9BQD1 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PMCHL2Q9BQD1 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PMCHL2Q9BQD1 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PMCHL2Q9BQD1 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PMCHL2Q9BQD1 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PMCHL2Q9BQD1 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PMCHL2Q9BQD1 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PMCHL2Q9BQD1 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PMCHL2Q9BQD1 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PMCHL2Q9BQD1 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PMCHL2Q9BQD1 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PMCHL2Q9BQD1 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PMCHL2Q9BQD1 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PMCHL2Q9BQD1 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PMCHL2Q9BQD1 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PMCHL2Q9BQD1 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PMCHL2Q9BQD1 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PMCHL2Q9BQD1 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PMCHL2Q9BQD1 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PMCHL2Q9BQD1 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PMCHL2Q9BQD1 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PMCHL2Q9BQD1 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PMCHL2Q9BQD1 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PMCHL2Q9BQD1 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PMCHL2Q9BQD1 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PMCHL2Q9BQD1 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PMCHL2Q9BQD1 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PMCHL2Q9BQD1 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PMCHL2Q9BQD1 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PMCHL2Q9BQD1 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PMCHL2Q9BQD1 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PMCHL2Q9BQD1 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PMCHL2Q9BQD1 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PMCHL2Q9BQD1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PMCHL2Q9BQD1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PMCHL2Q9BQD1 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PMCHL2Q9BQD1 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PMCHL2Q9BQD1 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PMCHL2Q9BQD1 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms