Protein–RNA interactions for Protein: Q99999

GAL3ST1, Galactosylceramide sulfotransferase, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAL3ST1Q99999 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GAL3ST1Q99999 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms