Protein–RNA interactions for Protein: Q99471

PFDN5, Prefoldin subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN5Q99471 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PFDN5Q99471 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PFDN5Q99471 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PFDN5Q99471 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms