Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CNBD2Q96M20 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CNBD2Q96M20 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CNBD2Q96M20 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CNBD2Q96M20 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CNBD2Q96M20 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CNBD2Q96M20 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CNBD2Q96M20 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CNBD2Q96M20 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CNBD2Q96M20 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CNBD2Q96M20 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CNBD2Q96M20 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CNBD2Q96M20 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CNBD2Q96M20 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CNBD2Q96M20 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CNBD2Q96M20 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CNBD2Q96M20 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CNBD2Q96M20 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CNBD2Q96M20 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CNBD2Q96M20 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CNBD2Q96M20 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CNBD2Q96M20 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CNBD2Q96M20 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CNBD2Q96M20 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CNBD2Q96M20 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CNBD2Q96M20 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CNBD2Q96M20 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CNBD2Q96M20 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CNBD2Q96M20 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CNBD2Q96M20 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CNBD2Q96M20 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CNBD2Q96M20 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CNBD2Q96M20 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CNBD2Q96M20 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CNBD2Q96M20 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CNBD2Q96M20 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CNBD2Q96M20 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms