Protein–RNA interactions for Protein: Q96K76

USP47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, humanhuman

Predictions only

Length 1,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP47Q96K76 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP47Q96K76 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
USP47Q96K76 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP47Q96K76 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
USP47Q96K76 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP47Q96K76 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP47Q96K76 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP47Q96K76 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP47Q96K76 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
USP47Q96K76 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP47Q96K76 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP47Q96K76 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP47Q96K76 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP47Q96K76 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP47Q96K76 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP47Q96K76 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP47Q96K76 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP47Q96K76 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP47Q96K76 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
USP47Q96K76 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP47Q96K76 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP47Q96K76 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP47Q96K76 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP47Q96K76 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP47Q96K76 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP47Q96K76 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP47Q96K76 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP47Q96K76 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP47Q96K76 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP47Q96K76 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP47Q96K76 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP47Q96K76 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP47Q96K76 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP47Q96K76 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP47Q96K76 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP47Q96K76 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP47Q96K76 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP47Q96K76 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
USP47Q96K76 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP47Q96K76 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP47Q96K76 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
USP47Q96K76 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP47Q96K76 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP47Q96K76 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP47Q96K76 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP47Q96K76 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP47Q96K76 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP47Q96K76 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP47Q96K76 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP47Q96K76 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP47Q96K76 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP47Q96K76 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP47Q96K76 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP47Q96K76 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP47Q96K76 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP47Q96K76 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP47Q96K76 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP47Q96K76 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP47Q96K76 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP47Q96K76 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP47Q96K76 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP47Q96K76 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP47Q96K76 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
USP47Q96K76 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP47Q96K76 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP47Q96K76 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP47Q96K76 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP47Q96K76 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP47Q96K76 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP47Q96K76 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP47Q96K76 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP47Q96K76 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP47Q96K76 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP47Q96K76 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP47Q96K76 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP47Q96K76 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP47Q96K76 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP47Q96K76 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP47Q96K76 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP47Q96K76 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP47Q96K76 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP47Q96K76 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
USP47Q96K76 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP47Q96K76 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP47Q96K76 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP47Q96K76 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
USP47Q96K76 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
USP47Q96K76 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP47Q96K76 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP47Q96K76 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP47Q96K76 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP47Q96K76 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP47Q96K76 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP47Q96K76 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP47Q96K76 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP47Q96K76 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP47Q96K76 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
USP47Q96K76 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
USP47Q96K76 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
USP47Q96K76 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms