Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDK5RAP3Q96JB5 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDK5RAP3Q96JB5 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDK5RAP3Q96JB5 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDK5RAP3Q96JB5 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDK5RAP3Q96JB5 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDK5RAP3Q96JB5 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDK5RAP3Q96JB5 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDK5RAP3Q96JB5 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDK5RAP3Q96JB5 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDK5RAP3Q96JB5 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDK5RAP3Q96JB5 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDK5RAP3Q96JB5 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDK5RAP3Q96JB5 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDK5RAP3Q96JB5 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDK5RAP3Q96JB5 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDK5RAP3Q96JB5 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDK5RAP3Q96JB5 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDK5RAP3Q96JB5 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDK5RAP3Q96JB5 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDK5RAP3Q96JB5 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDK5RAP3Q96JB5 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDK5RAP3Q96JB5 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDK5RAP3Q96JB5 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDK5RAP3Q96JB5 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDK5RAP3Q96JB5 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDK5RAP3Q96JB5 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDK5RAP3Q96JB5 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CDK5RAP3Q96JB5 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDK5RAP3Q96JB5 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDK5RAP3Q96JB5 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDK5RAP3Q96JB5 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CDK5RAP3Q96JB5 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CDK5RAP3Q96JB5 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDK5RAP3Q96JB5 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDK5RAP3Q96JB5 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDK5RAP3Q96JB5 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDK5RAP3Q96JB5 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDK5RAP3Q96JB5 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDK5RAP3Q96JB5 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDK5RAP3Q96JB5 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDK5RAP3Q96JB5 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDK5RAP3Q96JB5 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDK5RAP3Q96JB5 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDK5RAP3Q96JB5 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDK5RAP3Q96JB5 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDK5RAP3Q96JB5 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDK5RAP3Q96JB5 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDK5RAP3Q96JB5 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDK5RAP3Q96JB5 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDK5RAP3Q96JB5 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDK5RAP3Q96JB5 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDK5RAP3Q96JB5 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDK5RAP3Q96JB5 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDK5RAP3Q96JB5 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDK5RAP3Q96JB5 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDK5RAP3Q96JB5 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDK5RAP3Q96JB5 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CDK5RAP3Q96JB5 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CDK5RAP3Q96JB5 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDK5RAP3Q96JB5 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDK5RAP3Q96JB5 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CDK5RAP3Q96JB5 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CDK5RAP3Q96JB5 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDK5RAP3Q96JB5 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDK5RAP3Q96JB5 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CDK5RAP3Q96JB5 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDK5RAP3Q96JB5 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDK5RAP3Q96JB5 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CDK5RAP3Q96JB5 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CDK5RAP3Q96JB5 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDK5RAP3Q96JB5 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDK5RAP3Q96JB5 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDK5RAP3Q96JB5 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDK5RAP3Q96JB5 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDK5RAP3Q96JB5 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDK5RAP3Q96JB5 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CDK5RAP3Q96JB5 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDK5RAP3Q96JB5 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDK5RAP3Q96JB5 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDK5RAP3Q96JB5 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDK5RAP3Q96JB5 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDK5RAP3Q96JB5 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDK5RAP3Q96JB5 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDK5RAP3Q96JB5 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDK5RAP3Q96JB5 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDK5RAP3Q96JB5 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDK5RAP3Q96JB5 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDK5RAP3Q96JB5 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDK5RAP3Q96JB5 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDK5RAP3Q96JB5 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDK5RAP3Q96JB5 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CDK5RAP3Q96JB5 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDK5RAP3Q96JB5 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDK5RAP3Q96JB5 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDK5RAP3Q96JB5 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms