Protein–RNA interactions for Protein: Q96J65

ABCC12, Multidrug resistance-associated protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC12Q96J65 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ABCC12Q96J65 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ABCC12Q96J65 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ABCC12Q96J65 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ABCC12Q96J65 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ABCC12Q96J65 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ABCC12Q96J65 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ABCC12Q96J65 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ABCC12Q96J65 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ABCC12Q96J65 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ABCC12Q96J65 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ABCC12Q96J65 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ABCC12Q96J65 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ABCC12Q96J65 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ABCC12Q96J65 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ABCC12Q96J65 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ABCC12Q96J65 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ABCC12Q96J65 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ABCC12Q96J65 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ABCC12Q96J65 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ABCC12Q96J65 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ABCC12Q96J65 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ABCC12Q96J65 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ABCC12Q96J65 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ABCC12Q96J65 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ABCC12Q96J65 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ABCC12Q96J65 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ABCC12Q96J65 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ABCC12Q96J65 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.31
ABCC12Q96J65 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
ABCC12Q96J65 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ABCC12Q96J65 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ABCC12Q96J65 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ABCC12Q96J65 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ABCC12Q96J65 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ABCC12Q96J65 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ABCC12Q96J65 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ABCC12Q96J65 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ABCC12Q96J65 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ABCC12Q96J65 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ABCC12Q96J65 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ABCC12Q96J65 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ABCC12Q96J65 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ABCC12Q96J65 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ABCC12Q96J65 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ABCC12Q96J65 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ABCC12Q96J65 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ABCC12Q96J65 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ABCC12Q96J65 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ABCC12Q96J65 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ABCC12Q96J65 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ABCC12Q96J65 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ABCC12Q96J65 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ABCC12Q96J65 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ABCC12Q96J65 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ABCC12Q96J65 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ABCC12Q96J65 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ABCC12Q96J65 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ABCC12Q96J65 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ABCC12Q96J65 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ABCC12Q96J65 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ABCC12Q96J65 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ABCC12Q96J65 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ABCC12Q96J65 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ABCC12Q96J65 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ABCC12Q96J65 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ABCC12Q96J65 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ABCC12Q96J65 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ABCC12Q96J65 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ABCC12Q96J65 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ABCC12Q96J65 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ABCC12Q96J65 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ABCC12Q96J65 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ABCC12Q96J65 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ABCC12Q96J65 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ABCC12Q96J65 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ABCC12Q96J65 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ABCC12Q96J65 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ABCC12Q96J65 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ABCC12Q96J65 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ABCC12Q96J65 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ABCC12Q96J65 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ABCC12Q96J65 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ABCC12Q96J65 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ABCC12Q96J65 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ABCC12Q96J65 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ABCC12Q96J65 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ABCC12Q96J65 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ABCC12Q96J65 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ABCC12Q96J65 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ABCC12Q96J65 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ABCC12Q96J65 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ABCC12Q96J65 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ABCC12Q96J65 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ABCC12Q96J65 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ABCC12Q96J65 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ABCC12Q96J65 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ABCC12Q96J65 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ABCC12Q96J65 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ABCC12Q96J65 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms