Protein–RNA interactions for Protein: Q96E40

SPACA9, Sperm acrosome-associated protein 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPACA9Q96E40 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPACA9Q96E40 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPACA9Q96E40 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPACA9Q96E40 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPACA9Q96E40 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPACA9Q96E40 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPACA9Q96E40 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPACA9Q96E40 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPACA9Q96E40 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPACA9Q96E40 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPACA9Q96E40 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SPACA9Q96E40 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPACA9Q96E40 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPACA9Q96E40 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPACA9Q96E40 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPACA9Q96E40 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SPACA9Q96E40 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPACA9Q96E40 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPACA9Q96E40 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SPACA9Q96E40 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPACA9Q96E40 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPACA9Q96E40 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPACA9Q96E40 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPACA9Q96E40 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPACA9Q96E40 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPACA9Q96E40 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPACA9Q96E40 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPACA9Q96E40 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPACA9Q96E40 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPACA9Q96E40 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPACA9Q96E40 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPACA9Q96E40 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPACA9Q96E40 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPACA9Q96E40 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPACA9Q96E40 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPACA9Q96E40 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPACA9Q96E40 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPACA9Q96E40 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPACA9Q96E40 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPACA9Q96E40 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPACA9Q96E40 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPACA9Q96E40 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SPACA9Q96E40 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPACA9Q96E40 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPACA9Q96E40 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPACA9Q96E40 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPACA9Q96E40 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPACA9Q96E40 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPACA9Q96E40 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPACA9Q96E40 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPACA9Q96E40 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPACA9Q96E40 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPACA9Q96E40 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPACA9Q96E40 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPACA9Q96E40 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPACA9Q96E40 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPACA9Q96E40 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPACA9Q96E40 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPACA9Q96E40 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPACA9Q96E40 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SPACA9Q96E40 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SPACA9Q96E40 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SPACA9Q96E40 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SPACA9Q96E40 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SPACA9Q96E40 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SPACA9Q96E40 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPACA9Q96E40 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPACA9Q96E40 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPACA9Q96E40 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPACA9Q96E40 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SPACA9Q96E40 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SPACA9Q96E40 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPACA9Q96E40 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPACA9Q96E40 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPACA9Q96E40 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPACA9Q96E40 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPACA9Q96E40 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPACA9Q96E40 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPACA9Q96E40 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SPACA9Q96E40 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPACA9Q96E40 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPACA9Q96E40 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPACA9Q96E40 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPACA9Q96E40 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPACA9Q96E40 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPACA9Q96E40 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPACA9Q96E40 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPACA9Q96E40 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPACA9Q96E40 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPACA9Q96E40 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPACA9Q96E40 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPACA9Q96E40 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPACA9Q96E40 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPACA9Q96E40 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPACA9Q96E40 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPACA9Q96E40 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPACA9Q96E40 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPACA9Q96E40 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPACA9Q96E40 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SPACA9Q96E40 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms