Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NMD3Q96D46 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NMD3Q96D46 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NMD3Q96D46 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NMD3Q96D46 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NMD3Q96D46 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NMD3Q96D46 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NMD3Q96D46 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NMD3Q96D46 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NMD3Q96D46 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NMD3Q96D46 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NMD3Q96D46 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NMD3Q96D46 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NMD3Q96D46 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NMD3Q96D46 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NMD3Q96D46 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NMD3Q96D46 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NMD3Q96D46 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NMD3Q96D46 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NMD3Q96D46 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NMD3Q96D46 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NMD3Q96D46 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NMD3Q96D46 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NMD3Q96D46 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NMD3Q96D46 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NMD3Q96D46 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NMD3Q96D46 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NMD3Q96D46 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NMD3Q96D46 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
NMD3Q96D46 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NMD3Q96D46 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NMD3Q96D46 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NMD3Q96D46 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NMD3Q96D46 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NMD3Q96D46 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NMD3Q96D46 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NMD3Q96D46 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NMD3Q96D46 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NMD3Q96D46 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NMD3Q96D46 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NMD3Q96D46 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
NMD3Q96D46 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NMD3Q96D46 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
NMD3Q96D46 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NMD3Q96D46 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NMD3Q96D46 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NMD3Q96D46 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NMD3Q96D46 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NMD3Q96D46 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
NMD3Q96D46 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NMD3Q96D46 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NMD3Q96D46 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NMD3Q96D46 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NMD3Q96D46 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NMD3Q96D46 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NMD3Q96D46 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NMD3Q96D46 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NMD3Q96D46 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NMD3Q96D46 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NMD3Q96D46 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NMD3Q96D46 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NMD3Q96D46 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NMD3Q96D46 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NMD3Q96D46 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NMD3Q96D46 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NMD3Q96D46 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NMD3Q96D46 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NMD3Q96D46 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NMD3Q96D46 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NMD3Q96D46 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NMD3Q96D46 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NMD3Q96D46 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NMD3Q96D46 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NMD3Q96D46 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NMD3Q96D46 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NMD3Q96D46 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NMD3Q96D46 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NMD3Q96D46 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NMD3Q96D46 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NMD3Q96D46 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NMD3Q96D46 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NMD3Q96D46 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NMD3Q96D46 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NMD3Q96D46 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NMD3Q96D46 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NMD3Q96D46 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NMD3Q96D46 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NMD3Q96D46 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NMD3Q96D46 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NMD3Q96D46 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NMD3Q96D46 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NMD3Q96D46 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NMD3Q96D46 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NMD3Q96D46 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NMD3Q96D46 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NMD3Q96D46 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NMD3Q96D46 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NMD3Q96D46 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NMD3Q96D46 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NMD3Q96D46 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms