Protein–RNA interactions for Protein: Q96CB5

C8orf44, Putative uncharacterized protein C8orf44, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf44Q96CB5 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C8orf44Q96CB5 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C8orf44Q96CB5 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C8orf44Q96CB5 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C8orf44Q96CB5 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C8orf44Q96CB5 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C8orf44Q96CB5 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C8orf44Q96CB5 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C8orf44Q96CB5 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C8orf44Q96CB5 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C8orf44Q96CB5 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C8orf44Q96CB5 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C8orf44Q96CB5 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C8orf44Q96CB5 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C8orf44Q96CB5 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C8orf44Q96CB5 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C8orf44Q96CB5 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C8orf44Q96CB5 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
C8orf44Q96CB5 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
C8orf44Q96CB5 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C8orf44Q96CB5 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C8orf44Q96CB5 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C8orf44Q96CB5 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C8orf44Q96CB5 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C8orf44Q96CB5 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C8orf44Q96CB5 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C8orf44Q96CB5 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C8orf44Q96CB5 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C8orf44Q96CB5 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C8orf44Q96CB5 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C8orf44Q96CB5 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C8orf44Q96CB5 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C8orf44Q96CB5 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C8orf44Q96CB5 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C8orf44Q96CB5 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
C8orf44Q96CB5 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C8orf44Q96CB5 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C8orf44Q96CB5 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C8orf44Q96CB5 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C8orf44Q96CB5 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
C8orf44Q96CB5 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C8orf44Q96CB5 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
C8orf44Q96CB5 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C8orf44Q96CB5 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C8orf44Q96CB5 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C8orf44Q96CB5 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C8orf44Q96CB5 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C8orf44Q96CB5 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C8orf44Q96CB5 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C8orf44Q96CB5 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C8orf44Q96CB5 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C8orf44Q96CB5 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C8orf44Q96CB5 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C8orf44Q96CB5 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C8orf44Q96CB5 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C8orf44Q96CB5 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C8orf44Q96CB5 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C8orf44Q96CB5 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C8orf44Q96CB5 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C8orf44Q96CB5 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C8orf44Q96CB5 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C8orf44Q96CB5 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C8orf44Q96CB5 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C8orf44Q96CB5 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C8orf44Q96CB5 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C8orf44Q96CB5 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
C8orf44Q96CB5 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C8orf44Q96CB5 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C8orf44Q96CB5 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C8orf44Q96CB5 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C8orf44Q96CB5 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C8orf44Q96CB5 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C8orf44Q96CB5 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C8orf44Q96CB5 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C8orf44Q96CB5 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C8orf44Q96CB5 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C8orf44Q96CB5 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C8orf44Q96CB5 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C8orf44Q96CB5 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C8orf44Q96CB5 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C8orf44Q96CB5 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C8orf44Q96CB5 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C8orf44Q96CB5 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
C8orf44Q96CB5 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C8orf44Q96CB5 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C8orf44Q96CB5 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C8orf44Q96CB5 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C8orf44Q96CB5 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C8orf44Q96CB5 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C8orf44Q96CB5 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C8orf44Q96CB5 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C8orf44Q96CB5 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C8orf44Q96CB5 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C8orf44Q96CB5 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C8orf44Q96CB5 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C8orf44Q96CB5 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C8orf44Q96CB5 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C8orf44Q96CB5 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C8orf44Q96CB5 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C8orf44Q96CB5 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms