Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RUNDC1Q96C34 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RUNDC1Q96C34 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RUNDC1Q96C34 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RUNDC1Q96C34 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RUNDC1Q96C34 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RUNDC1Q96C34 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RUNDC1Q96C34 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RUNDC1Q96C34 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
RUNDC1Q96C34 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RUNDC1Q96C34 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RUNDC1Q96C34 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RUNDC1Q96C34 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RUNDC1Q96C34 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RUNDC1Q96C34 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RUNDC1Q96C34 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RUNDC1Q96C34 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RUNDC1Q96C34 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RUNDC1Q96C34 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RUNDC1Q96C34 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RUNDC1Q96C34 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RUNDC1Q96C34 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RUNDC1Q96C34 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RUNDC1Q96C34 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RUNDC1Q96C34 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RUNDC1Q96C34 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RUNDC1Q96C34 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RUNDC1Q96C34 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
RUNDC1Q96C34 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RUNDC1Q96C34 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RUNDC1Q96C34 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RUNDC1Q96C34 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RUNDC1Q96C34 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RUNDC1Q96C34 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
RUNDC1Q96C34 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
RUNDC1Q96C34 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RUNDC1Q96C34 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RUNDC1Q96C34 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RUNDC1Q96C34 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RUNDC1Q96C34 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RUNDC1Q96C34 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RUNDC1Q96C34 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RUNDC1Q96C34 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RUNDC1Q96C34 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RUNDC1Q96C34 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RUNDC1Q96C34 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RUNDC1Q96C34 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RUNDC1Q96C34 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RUNDC1Q96C34 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RUNDC1Q96C34 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RUNDC1Q96C34 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RUNDC1Q96C34 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RUNDC1Q96C34 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RUNDC1Q96C34 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RUNDC1Q96C34 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RUNDC1Q96C34 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RUNDC1Q96C34 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RUNDC1Q96C34 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RUNDC1Q96C34 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RUNDC1Q96C34 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RUNDC1Q96C34 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RUNDC1Q96C34 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RUNDC1Q96C34 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
RUNDC1Q96C34 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RUNDC1Q96C34 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RUNDC1Q96C34 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RUNDC1Q96C34 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RUNDC1Q96C34 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
RUNDC1Q96C34 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RUNDC1Q96C34 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RUNDC1Q96C34 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RUNDC1Q96C34 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RUNDC1Q96C34 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RUNDC1Q96C34 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RUNDC1Q96C34 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RUNDC1Q96C34 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RUNDC1Q96C34 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RUNDC1Q96C34 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RUNDC1Q96C34 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RUNDC1Q96C34 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RUNDC1Q96C34 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RUNDC1Q96C34 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RUNDC1Q96C34 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RUNDC1Q96C34 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RUNDC1Q96C34 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RUNDC1Q96C34 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RUNDC1Q96C34 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RUNDC1Q96C34 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RUNDC1Q96C34 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RUNDC1Q96C34 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RUNDC1Q96C34 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RUNDC1Q96C34 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RUNDC1Q96C34 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RUNDC1Q96C34 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RUNDC1Q96C34 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RUNDC1Q96C34 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RUNDC1Q96C34 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RUNDC1Q96C34 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RUNDC1Q96C34 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
RUNDC1Q96C34 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms