Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 71 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPTSSAQ969W0 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms