Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
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GTF3C6Q969F1 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF3C6Q969F1 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF3C6Q969F1 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF3C6Q969F1 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF3C6Q969F1 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF3C6Q969F1 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF3C6Q969F1 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF3C6Q969F1 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF3C6Q969F1 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF3C6Q969F1 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF3C6Q969F1 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF3C6Q969F1 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF3C6Q969F1 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF3C6Q969F1 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF3C6Q969F1 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
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GTF3C6Q969F1 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF3C6Q969F1 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF3C6Q969F1 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF3C6Q969F1 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF3C6Q969F1 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF3C6Q969F1 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
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GTF3C6Q969F1 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF3C6Q969F1 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF3C6Q969F1 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF3C6Q969F1 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF3C6Q969F1 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF3C6Q969F1 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF3C6Q969F1 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF3C6Q969F1 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF3C6Q969F1 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF3C6Q969F1 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF3C6Q969F1 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GTF3C6Q969F1 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
GTF3C6Q969F1 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GTF3C6Q969F1 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GTF3C6Q969F1 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GTF3C6Q969F1 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
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GTF3C6Q969F1 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GTF3C6Q969F1 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
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GTF3C6Q969F1 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
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GTF3C6Q969F1 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GTF3C6Q969F1 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
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GTF3C6Q969F1 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
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GTF3C6Q969F1 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
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GTF3C6Q969F1 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF3C6Q969F1 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GTF3C6Q969F1 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GTF3C6Q969F1 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GTF3C6Q969F1 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GTF3C6Q969F1 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
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GTF3C6Q969F1 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
GTF3C6Q969F1 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GTF3C6Q969F1 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GTF3C6Q969F1 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GTF3C6Q969F1 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GTF3C6Q969F1 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
GTF3C6Q969F1 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GTF3C6Q969F1 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GTF3C6Q969F1 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GTF3C6Q969F1 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GTF3C6Q969F1 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GTF3C6Q969F1 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GTF3C6Q969F1 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GTF3C6Q969F1 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GTF3C6Q969F1 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GTF3C6Q969F1 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GTF3C6Q969F1 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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