Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXA3

RUFY2, RUN and FYVE domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY2Q8WXA3 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RUFY2Q8WXA3 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RUFY2Q8WXA3 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RUFY2Q8WXA3 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RUFY2Q8WXA3 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RUFY2Q8WXA3 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RUFY2Q8WXA3 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RUFY2Q8WXA3 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RUFY2Q8WXA3 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RUFY2Q8WXA3 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RUFY2Q8WXA3 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RUFY2Q8WXA3 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RUFY2Q8WXA3 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RUFY2Q8WXA3 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RUFY2Q8WXA3 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RUFY2Q8WXA3 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RUFY2Q8WXA3 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RUFY2Q8WXA3 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RUFY2Q8WXA3 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RUFY2Q8WXA3 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RUFY2Q8WXA3 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RUFY2Q8WXA3 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RUFY2Q8WXA3 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RUFY2Q8WXA3 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RUFY2Q8WXA3 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RUFY2Q8WXA3 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RUFY2Q8WXA3 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RUFY2Q8WXA3 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RUFY2Q8WXA3 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RUFY2Q8WXA3 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RUFY2Q8WXA3 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RUFY2Q8WXA3 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RUFY2Q8WXA3 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RUFY2Q8WXA3 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RUFY2Q8WXA3 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RUFY2Q8WXA3 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RUFY2Q8WXA3 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RUFY2Q8WXA3 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RUFY2Q8WXA3 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RUFY2Q8WXA3 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RUFY2Q8WXA3 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RUFY2Q8WXA3 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RUFY2Q8WXA3 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RUFY2Q8WXA3 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RUFY2Q8WXA3 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RUFY2Q8WXA3 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RUFY2Q8WXA3 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RUFY2Q8WXA3 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RUFY2Q8WXA3 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RUFY2Q8WXA3 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RUFY2Q8WXA3 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RUFY2Q8WXA3 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RUFY2Q8WXA3 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RUFY2Q8WXA3 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RUFY2Q8WXA3 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RUFY2Q8WXA3 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RUFY2Q8WXA3 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RUFY2Q8WXA3 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RUFY2Q8WXA3 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RUFY2Q8WXA3 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RUFY2Q8WXA3 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RUFY2Q8WXA3 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RUFY2Q8WXA3 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RUFY2Q8WXA3 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RUFY2Q8WXA3 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RUFY2Q8WXA3 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RUFY2Q8WXA3 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RUFY2Q8WXA3 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RUFY2Q8WXA3 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RUFY2Q8WXA3 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RUFY2Q8WXA3 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RUFY2Q8WXA3 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RUFY2Q8WXA3 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RUFY2Q8WXA3 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RUFY2Q8WXA3 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RUFY2Q8WXA3 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RUFY2Q8WXA3 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RUFY2Q8WXA3 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RUFY2Q8WXA3 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RUFY2Q8WXA3 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RUFY2Q8WXA3 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RUFY2Q8WXA3 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RUFY2Q8WXA3 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RUFY2Q8WXA3 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RUFY2Q8WXA3 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RUFY2Q8WXA3 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RUFY2Q8WXA3 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RUFY2Q8WXA3 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RUFY2Q8WXA3 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RUFY2Q8WXA3 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RUFY2Q8WXA3 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RUFY2Q8WXA3 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RUFY2Q8WXA3 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RUFY2Q8WXA3 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RUFY2Q8WXA3 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RUFY2Q8WXA3 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RUFY2Q8WXA3 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RUFY2Q8WXA3 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RUFY2Q8WXA3 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RUFY2Q8WXA3 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms