Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV48

CCDC107, Coiled-coil domain-containing protein 107, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC107Q8WV48 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CCDC107Q8WV48 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms