Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEB9

RHBDD1, Rhomboid-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD1Q8TEB9 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RHBDD1Q8TEB9 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RHBDD1Q8TEB9 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RHBDD1Q8TEB9 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RHBDD1Q8TEB9 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RHBDD1Q8TEB9 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RHBDD1Q8TEB9 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RHBDD1Q8TEB9 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RHBDD1Q8TEB9 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RHBDD1Q8TEB9 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
RHBDD1Q8TEB9 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RHBDD1Q8TEB9 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RHBDD1Q8TEB9 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RHBDD1Q8TEB9 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHBDD1Q8TEB9 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHBDD1Q8TEB9 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHBDD1Q8TEB9 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHBDD1Q8TEB9 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHBDD1Q8TEB9 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHBDD1Q8TEB9 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHBDD1Q8TEB9 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHBDD1Q8TEB9 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHBDD1Q8TEB9 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHBDD1Q8TEB9 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHBDD1Q8TEB9 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHBDD1Q8TEB9 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHBDD1Q8TEB9 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHBDD1Q8TEB9 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms