Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAL5

C9orf43, Uncharacterized protein C9orf43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf43Q8TAL5 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C9orf43Q8TAL5 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C9orf43Q8TAL5 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C9orf43Q8TAL5 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C9orf43Q8TAL5 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
C9orf43Q8TAL5 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C9orf43Q8TAL5 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C9orf43Q8TAL5 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C9orf43Q8TAL5 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C9orf43Q8TAL5 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C9orf43Q8TAL5 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C9orf43Q8TAL5 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C9orf43Q8TAL5 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C9orf43Q8TAL5 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C9orf43Q8TAL5 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C9orf43Q8TAL5 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C9orf43Q8TAL5 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C9orf43Q8TAL5 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C9orf43Q8TAL5 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C9orf43Q8TAL5 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C9orf43Q8TAL5 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C9orf43Q8TAL5 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C9orf43Q8TAL5 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C9orf43Q8TAL5 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C9orf43Q8TAL5 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C9orf43Q8TAL5 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C9orf43Q8TAL5 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C9orf43Q8TAL5 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C9orf43Q8TAL5 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C9orf43Q8TAL5 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C9orf43Q8TAL5 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C9orf43Q8TAL5 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C9orf43Q8TAL5 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C9orf43Q8TAL5 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C9orf43Q8TAL5 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C9orf43Q8TAL5 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C9orf43Q8TAL5 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C9orf43Q8TAL5 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C9orf43Q8TAL5 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
C9orf43Q8TAL5 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
C9orf43Q8TAL5 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
C9orf43Q8TAL5 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C9orf43Q8TAL5 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C9orf43Q8TAL5 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C9orf43Q8TAL5 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C9orf43Q8TAL5 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C9orf43Q8TAL5 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
C9orf43Q8TAL5 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C9orf43Q8TAL5 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C9orf43Q8TAL5 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C9orf43Q8TAL5 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C9orf43Q8TAL5 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C9orf43Q8TAL5 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf43Q8TAL5 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf43Q8TAL5 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf43Q8TAL5 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf43Q8TAL5 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf43Q8TAL5 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf43Q8TAL5 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf43Q8TAL5 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf43Q8TAL5 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf43Q8TAL5 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf43Q8TAL5 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf43Q8TAL5 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf43Q8TAL5 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf43Q8TAL5 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf43Q8TAL5 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf43Q8TAL5 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf43Q8TAL5 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf43Q8TAL5 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf43Q8TAL5 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf43Q8TAL5 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf43Q8TAL5 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf43Q8TAL5 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf43Q8TAL5 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf43Q8TAL5 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf43Q8TAL5 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf43Q8TAL5 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf43Q8TAL5 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf43Q8TAL5 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf43Q8TAL5 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf43Q8TAL5 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf43Q8TAL5 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf43Q8TAL5 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf43Q8TAL5 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf43Q8TAL5 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf43Q8TAL5 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf43Q8TAL5 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf43Q8TAL5 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C9orf43Q8TAL5 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C9orf43Q8TAL5 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C9orf43Q8TAL5 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C9orf43Q8TAL5 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C9orf43Q8TAL5 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C9orf43Q8TAL5 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C9orf43Q8TAL5 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C9orf43Q8TAL5 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C9orf43Q8TAL5 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C9orf43Q8TAL5 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C9orf43Q8TAL5 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms