Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG08

HELB, DNA helicase B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELBQ8NG08 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HELBQ8NG08 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HELBQ8NG08 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HELBQ8NG08 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HELBQ8NG08 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HELBQ8NG08 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HELBQ8NG08 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
HELBQ8NG08 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HELBQ8NG08 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
HELBQ8NG08 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HELBQ8NG08 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HELBQ8NG08 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
HELBQ8NG08 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HELBQ8NG08 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HELBQ8NG08 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HELBQ8NG08 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HELBQ8NG08 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HELBQ8NG08 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
HELBQ8NG08 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HELBQ8NG08 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HELBQ8NG08 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HELBQ8NG08 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HELBQ8NG08 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HELBQ8NG08 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HELBQ8NG08 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HELBQ8NG08 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HELBQ8NG08 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HELBQ8NG08 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HELBQ8NG08 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HELBQ8NG08 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HELBQ8NG08 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HELBQ8NG08 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HELBQ8NG08 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HELBQ8NG08 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HELBQ8NG08 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HELBQ8NG08 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HELBQ8NG08 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HELBQ8NG08 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HELBQ8NG08 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HELBQ8NG08 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HELBQ8NG08 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HELBQ8NG08 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HELBQ8NG08 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HELBQ8NG08 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HELBQ8NG08 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HELBQ8NG08 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HELBQ8NG08 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HELBQ8NG08 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HELBQ8NG08 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HELBQ8NG08 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HELBQ8NG08 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HELBQ8NG08 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HELBQ8NG08 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HELBQ8NG08 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HELBQ8NG08 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HELBQ8NG08 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HELBQ8NG08 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
HELBQ8NG08 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HELBQ8NG08 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HELBQ8NG08 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HELBQ8NG08 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
HELBQ8NG08 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HELBQ8NG08 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HELBQ8NG08 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HELBQ8NG08 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HELBQ8NG08 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HELBQ8NG08 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HELBQ8NG08 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HELBQ8NG08 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HELBQ8NG08 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HELBQ8NG08 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
HELBQ8NG08 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HELBQ8NG08 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HELBQ8NG08 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
HELBQ8NG08 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HELBQ8NG08 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
HELBQ8NG08 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HELBQ8NG08 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HELBQ8NG08 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HELBQ8NG08 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HELBQ8NG08 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HELBQ8NG08 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HELBQ8NG08 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HELBQ8NG08 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HELBQ8NG08 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HELBQ8NG08 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HELBQ8NG08 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HELBQ8NG08 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
HELBQ8NG08 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HELBQ8NG08 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HELBQ8NG08 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HELBQ8NG08 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HELBQ8NG08 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HELBQ8NG08 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HELBQ8NG08 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
HELBQ8NG08 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HELBQ8NG08 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HELBQ8NG08 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HELBQ8NG08 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HELBQ8NG08 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms